结论：工伤后工厂扣年假一般是不合法的，但具体还需根据实际情况和相关法律法规来判断。
分析说明：
年假的法律性质：
- 年假是劳动者的法定休息权利，根据《职工带薪年休假条例》的规定，劳动者在连续工作一定年限后，有权享受带薪年休假。这是劳动者的一项基本权益，不应被随意剥夺。
工伤与年假的关系：
- 工伤是劳动者在工作时间或工作场所内，因工作原因受到的事故伤害或职业病。工伤期间，劳动者有权享受工伤保险待遇，包括医疗救治、停工留薪期工资等。
- 年假与工伤是两个独立的法律概念，工伤的发生并不影响劳动者享受年假的权利。除非有特别规定或双方协商一致，否则工厂不能因工伤而扣除劳动者的年假。
工厂扣年假的合法性分析：
- 如果工厂在劳动者工伤期间扣除年假，且没有合理的理由或法律依据，那么这种行为很可能是违法的。劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 然而，如果双方在劳动合同或集体合同中有特别约定，或者劳动者同意在工伤期间扣除年假作为调休或其他安排，那么这种行为可能是合法的。但这种情况需要明确的书面约定或劳动者本人的明确同意。
法律建议：
- 劳动者：如果遭遇工厂在工伤期间扣除年假的情况，首先应查看劳动合同或集体合同中是否有相关约定。如果没有约定或约定不明确，可以向工厂提出异议，并要求恢复年假或给予相应的补偿。如果工厂拒绝，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 工厂：应严格遵守相关法律法规，尊重劳动者的年假权利。在工伤期间，除非有特别约定或劳动者同意，否则不应扣除年假。如果确实需要调整劳动者的休息时间，应与劳动者协商一致，并签订书面协议。
可能后果：
- 如果工厂违法扣除年假，可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
- 劳动者也可能因此解除劳动合同，并要求工厂支付经济补偿金。
进一步思考：
- 在实际操作中，劳动者和工厂应加强沟通，明确各自的权利和义务，避免类似纠纷的发生。
- 工厂应建立健全的规章制度，明确年假的享受条件和扣除情形，确保劳动者的合法权益得到保障。
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