在行政诉讼中，被告当庭提交证据的有效性并非绝对，而是取决于多个因素的综合考量。以下是对此问题的详细分析：
一、总体原则与法律规定
行政诉讼法及其相关司法解释对证据的提交有明确的时间要求，通常要求当事人在法院指定的交换证据之日或开庭审理前提交证据。这一规定旨在确保诉讼的公正性、高效性和有序性，防止庭审中出现突然的新证据，从而保障对方当事人的权益及法庭的审理节奏。
二、被告当庭提交证据的有效情形
经法院准许的补充证据：
- 若原告或第三人提出了在行政处理程序中未提出的理由或证据，且经法院准许，被告可以补充证据。在此情形下，被告当庭提交的补充证据可能是有效的。
- 法律依据：根据《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》，被告在特定情况下，经法院准许，可以在法庭调查中提供补充证据。
因正当事由逾期提交的证据：
- 若被告因不可抗力或客观上不能控制的其他正当事由（如自然灾害导致的交通中断等）无法在举证期限内提交证据，且在正当事由消除后及时向法院说明情况并申请延期提交，经法院准许后，当庭提交的证据可能是有效的。
- 法律依据：被告因不可抗力或客观上不能控制的其他正当事由不能在法定期限内提供证据的，应向法院提出延期提供证据的书面申请。法院准许延期提供的，被告应在正当事由消除后十日内提供证据。
三、被告当庭提交证据的无效情形
无正当理由逾期提交的证据：
- 若被告无正当理由逾期提供证据，或在当庭才提交证据且未经法院准许，该证据将被视为无效，被告需承担举证不能的不利后果。
- 法律依据：根据行政诉讼法的相关规定，被告逾期提供证据的，视为被诉具体行政行为没有相应的证据。
证据与案件无关联性或真实性存疑：
- 即使被告当庭提交了证据，如果法院审查后认为该证据与案件无关联性或真实性存疑，该证据也将被视为无效。
- 法律依据：法院在审理过程中需对证据的真实性、合法性和关联性进行全面、客观的审查判断。
四、法院对当庭提交证据的审查
- 无论被告当庭提交的证据是否经法院准许，法院都需对该证据进行严格的审查判断。这包括证据的真实性、合法性以及与案件的关联性等方面。只有经过法院审查认定有效的证据，才能作为判决的依据。
五、建议与总结
- 严格遵守举证期限：被告在行政诉讼中应尽量按照规定的时间和要求提交证据，以避免因证据提交问题而影响自己的合法权益。
- 及时申请延期提交：如确实存在特殊情况需要当庭提交证据，被告应及时向法院说明情况并申请延期提交，以确保诉讼权利得到有效保障。
- 确保证据质量：被告在提交证据时，应确保证据的真实性、合法性和关联性，以提高证据被法院采纳的可能性。
综上所述，行政诉讼中被告当庭提交证据的有效性取决于多个因素的综合考虑。因此，被告在诉讼过程中应严格遵守相关规定，确保证据的及时、有效提交。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。