结论前置：不可以仅起诉要求公司补缴公积金和养老保险，但可以在维权过程中要求公司补缴全部未依法缴纳的五险一金项目。以下从法律程序、维权策略、实务操作三个角度展开说明：

一、法律程序角度：社保与公积金的缴纳具有法定强制性

根据《社会保险法》第58条、第60条及《住房公积金管理条例》第13条、第20条，用人单位必须为员工同时缴纳养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险（即“五险”）及住房公积金（即“一金”），任何单项的免缴均无法律依据。若公司未依法缴纳，员工可通过以下途径维权：

1. 行政投诉：向当地社保部门（如社保局、医保局）投诉要求补缴五险，向住房公积金管理中心投诉要求补缴公积金。行政机关有权责令公司限期补缴，并可加收滞纳金或罚款。
2. 劳动仲裁/诉讼：若公司拒不执行行政决定，员工可申请劳动仲裁或向法院起诉。但仲裁/诉讼的请求需基于完整的劳动关系权利，即要求公司补缴全部未缴项目（五险+一金），而非选择性主张。

关键点：法律未赋予员工“拆分”五险一金进行维权的选择权，行政机关或司法机关会依据法定职责要求公司全面履行缴纳义务。

二、维权策略角度：选择性主张可能影响权益完整性

若员工仅要求补缴公积金和养老保险，可能面临以下风险：

1. 遗漏其他权益：医疗保险、失业保险等直接影响员工当前或未来的医疗、失业保障，工伤保险和生育保险则涉及工伤赔偿、生育津贴等潜在利益。放弃主张可能导致未来无法享受相关待遇。
2. 程序效率降低：社保与公积金的补缴需分别通过社保部门和公积金管理中心处理，若分两次主张，可能延长维权周期，增加时间成本。
3. 公司抗辩风险：公司可能以“员工自愿放弃部分社保”为由抗辩（尽管此类约定因违法而无效），但选择性主张可能被公司利用为“员工已部分放弃权益”的借口，增加争议复杂性。

建议：在维权时明确要求公司补缴全部五险一金项目，避免因部分放弃导致权益受损。

三、实务操作角度：如何高效主张全部权益？

1. 收集证据：保留劳动合同、工资条、考勤记录等证明劳动关系的材料，以及公司未缴纳社保和公积金的证据（如社保查询记录、公积金账户截图等）。
2. 联合投诉：向社保部门和公积金管理中心同时提交投诉材料，要求两部门联合处理，提高补缴效率。
3. 法律文书撰写：若需仲裁或诉讼，在起诉状或仲裁申请书中明确列明要求公司补缴“养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险及住房公积金”的具体金额和期限。
4. 关注时效：根据《劳动争议调解仲裁法》第27条，劳动争议申请仲裁的时效为1年，从知道或应当知道权利被侵害之日起计算。但社保补缴可能不受1年时效限制（具体以地方规定为准），建议尽快行动。

总结：公司未依法缴纳五险一金时，员工应通过行政投诉或法律途径要求公司全面补缴，而非仅主张部分项目。若您需要进一步了解维权流程或需要法律文书协助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细指导。