当建设工程施工合同无效时，其结算规则是否有效需根据具体情况来判断，但总体原则是：若工程经竣工验收合格，承包人有权请求参照合同约定支付工程价款；若不合格，则需根据修复情况及双方约定处理。以下是对此问题的详细分析：
一、工程质量合格时的结算规则
参照合同约定结算：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，即使建设工程施工合同无效，但只要建设工程经竣工验收合格，承包人仍有权请求参照合同约定支付工程价款。这一原则体现了对承包人实际投入和建设成果的尊重，也维护了交易秩序和公平原则。
- 实例说明：如甲建筑公司与乙开发商签订的建设工程施工合同因违反法律法规被认定为无效，但工程经竣工验收合格，甲公司仍有权按合同约定要求乙开发商支付工程款。
根据实际履行情况调整：
- 若实际履行与合同约定存在差异，如工程变更、材料替换等，应据实调整工程款。这要求双方在结算时，结合实际情况，对合同约定的计价方式、计价标准进行适当调整。
- 实例说明：如因设计变更导致工程量增加，应按实际完成量结合合同单价计算工程款，而非完全按照原合同约定执行。
二、工程质量不合格时的结算规则
修复后合格：
- 若建设工程经验收不合格，但经过修复后达到合格标准，承包人有权要求发包人参照合同约定支付工程款，但需扣除相应的修复费用。这体现了对承包人劳动成果的认可，同时也要求其承担因质量问题而产生的修复费用。
- 实例说明：如某工程部分施工不符标准，经验收不合格后，承包人进行修复并再次验收合格，发包人可扣除修复费用后支付剩余工程款。
修复后仍不合格：
- 若修复后的建设工程仍不符合质量标准，承包人无权主张工程款，反而可能需承担违约责任或赔偿发包人的损失。这是因为承包人未能完成合同约定的义务，即提供符合质量要求的工程。
- 实例说明：如基础施工存在严重质量问题，修复后仍不合格，承包人不仅无法获得工程款，还需赔偿发包人因此遭受的损失，如重新施工的费用、工期延误的损失等。
三、特殊情形下的结算规则
转包、违法分包与挂靠情形：
- 在转包、违法分包及挂靠关系中，实际施工人虽不具备直接主张工程款的合同依据，但基于保护农民工权益等考量，可突破合同相对性向发包人主张权利。此时需结合各方过错程度、实际施工贡献等因素综合判定责任分担比例。
- 实例说明：如某工程被转包给无资质的施工队，施工队完成部分工程后因质量问题被要求修复，修复后仍不合格，此时发包人可能需根据过错程度承担一定责任，而施工队则可能无法获得全额工程款。
未完工工程的结算：
- 对于尚未完工的建设工程，若合同无效，通常按已完工程的合格部分进行折价补偿。此时，折价补偿的标准可能涉及已完成工程的质量评估、市场价值等因素。
- 实例说明：如某工程因发包人原因导致停工，且合同被认定为无效，此时承包人可就已完成的合格部分工程主张折价补偿，补偿标准可能参照市场价格或进行鉴定评估。
四、处理建议与注意事项
- 确定工程质量：首要任务是确保工程质量符合标准，以作为结算依据。双方应在工程竣工后及时组织验收，并保留好验收报告等相关证据。
- 协商与调解：在争议发生后，双方应首先尝试通过协商或调解的方式解决纠纷。这有助于节省诉讼成本和时间，同时也有利于维护双方的合作关系。
- 保留证据：无论是协商还是诉讼，都应妥善保管相关文件和资料作为证据。如工程量清单、施工图纸、签证单、付款凭证、质量验收报告等。
- 了解法律法规：熟悉相关法律法规和政策规定，以更好地维护自身权益并规避法律风险。如《中华人民共和国民法典》、《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》等。
- 诉诸法律途径：若无法达成一致意见，可通过法律途径解决争议，如向人民法院提起诉讼或申请仲裁机构裁决。在此过程中，法院或仲裁机构将根据案件事实和法律规定作出公正裁决。
综上所述，建设工程施工合同无效时的工程款结算问题需综合考虑工程质量、合同约定及实际情况等多方面因素。双方应保持冷静理性，通过协商、调解或法律途径解决争议，并确保工程款的合理支付。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。