盒马鲜生门店员工通常与盒马鲜生所属的公司直接签订劳动合同，但具体签订主体可能因实际情况有所不同，以下从不同角度进行分析：
直接签订情况：
- 在大多数情况下，盒马鲜生门店的员工会直接与盒马鲜生所属的公司（如上海盒马网络科技有限公司或其关联公司）签订劳动合同。这种情况下，员工与盒马鲜生之间建立了直接的劳动关系，享受公司提供的各项福利待遇，并受公司规章制度的约束。
特殊签订情况：
- 劳务派遣：虽然不常见，但理论上存在盒马鲜生通过劳务派遣公司雇佣员工的情况。在这种情况下，员工实际上是与劳务派遣公司签订劳动合同，然后被派遣到盒马鲜生门店工作。这种情况下，员工的劳动关系在劳务派遣公司，但实际工作在盒马鲜生门店。不过，根据《劳动合同法》的相关规定，劳务派遣一般在临时性、辅助性或者替代性的工作岗位上实施，且劳务派遣单位应当与被派遣劳动者订立二年以上的固定期限劳动合同，按月支付劳动报酬。
- 关联公司签订：如果盒马鲜生有多个关联公司，且这些关联公司之间存在人员调配或共享的情况，那么员工可能会与其中一个关联公司签订劳动合同，但实际上在盒马鲜生门店工作。这种情况下，需要明确劳动合同中的工作地、工作内容等条款，以确保员工的权益不受损害。
法律建议：
- 对于员工而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工作内容、工作地点、劳动报酬、社会保险等方面的约定。如果合同中有任何不明确或模糊的地方，应及时向公司或法律专业人士咨询，以确保自己的权益得到充分保障。
- 对于公司而言，应严格遵守《劳动合同法》等相关法律法规的规定，与员工签订合法有效的劳动合同，并按照合同约定履行各项义务。同时，公司也应建立健全的规章制度，保障员工的合法权益，营造和谐稳定的劳动关系。
在实际操作中，如果员工对与谁签订劳动合同存在疑问或不确定，可以直接向盒马鲜生门店的人力资源部门或相关负责人咨询，以获取最准确的信息。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，也可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律意见。