将员工的健康证扔掉这一行为，是否违法需分情况讨论：

1. 若健康证属于员工个人物品：

   • 健康证作为员工个人通过合法程序获得的证件，具有个人财产的属性。根据《中华人民共和国民法典》中关于物权保护的相关规定，员工对其个人物品享有占有、使用、收益和处分的权利。
   • 雇主或公司未经员工同意，擅自扔掉其健康证，可能构成对员工个人财产权的侵犯。员工有权要求雇主或公司承担相应的民事责任，如赔偿损失或恢复原状。

2. 若健康证属于公司管理范畴内的文件（但这种情况较为特殊且少见，因为健康证通常是员工个人办理的）：

   • 即便健康证被视为公司管理的一部分，公司也应按照合理的程序和规定进行处理，如归档、保存或销毁（在符合法律法规的前提下）。
   • 擅自扔掉可能仍涉及管理不当或违反内部规定的问题，但不一定直接构成违法。不过，如果因此导致员工权益受损（如需要健康证时无法提供），公司可能需承担相应的责任。

3. 从劳动法律关系的角度：

   • 健康证是员工从事特定工作（如食品加工、餐饮服务等）的必备证件，也是雇主确保员工符合健康要求、保障工作场所安全的重要措施。
   • 雇主有责任妥善保管员工的健康证或确保其有效性。如果因雇主的原因导致健康证丢失或失效，且因此给员工造成损失（如无法继续工作、被罚款等），雇主应承担相应的赔偿责任。

建议：

• 对于雇主：应尊重员工的个人财产权，妥善保管或处理员工的健康证。如果不再需要，应按照合理的程序进行销毁或归还员工，避免不必要的法律纠纷。
• 对于员工：如果发现雇主擅自扔掉了自己的健康证，应及时与雇主沟通，要求其承担相应的责任。如果沟通无果，可以考虑通过法律途径维护自己的权益。

总结：将员工的健康证扔掉是否违法，取决于健康证的性质以及雇主的处理方式。在大多数情况下，健康证属于员工个人物品，雇主擅自扔掉可能构成侵权。因此，建议雇主在处理员工健康证时务必谨慎，避免不必要的法律风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。