结论：针对您撞了营运车辆赔了钱但对方跑了不给公司的情况，您需要采取一系列措施来维护自己的合法权益，包括收集证据、与对方沟通、向相关部门投诉以及考虑法律途径解决。

详细分析：

1. 收集并保留证据：

   • 首先，确保您已经收集了所有与事故相关的证据，包括事故现场的照片、视频、交警出具的事故责任认定书、与对方驾驶员的沟通记录（如短信、微信、电话录音等）、赔偿协议或收据等。
   • 这些证据将对您后续维权至关重要，它们能够证明事故的责任归属、赔偿的金额以及对方已经接受赔偿的事实。

2. 尝试与对方沟通：

   • 在采取进一步行动之前，您可以尝试通过电话、短信或其他方式与对方驾驶员取得联系，了解其为何未将赔偿款交给公司，并要求其尽快履行义务。
   • 如果对方驾驶员拒绝沟通或无法联系到，您可以考虑通过其所在公司或相关机构进行联系。

3. 向相关部门投诉：

   • 如果对方驾驶员仍然拒绝履行义务，您可以向当地的交通运输管理部门或相关监管机构投诉，说明情况并提供相关证据。
   • 这些部门可能会介入调查，并协调双方解决问题。如果对方驾驶员的行为构成违法或违规，相关部门还可能对其进行处罚。

4. 考虑法律途径解决：

   • 如果上述措施均无法解决问题，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 您可以向法院提起民事诉讼，要求对方驾驶员或其所在公司返还您已经支付的赔偿款，并可能要求赔偿因对方违约而给您造成的损失（如诉讼费用、律师费用等）。
   • 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明自己的主张，并遵循法院的审理程序。

法律背景与建议：

• 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，交通事故的责任方应当承担相应的赔偿责任。如果您已经按照事故责任认定书的要求支付了赔偿款，但对方驾驶员未将其交给公司，这并不影响您已经履行了赔偿义务的事实。
• 在处理此类纠纷时，建议您保持冷静和理性，避免与对方发生不必要的冲突。同时，及时咨询专业律师（即我，岳雷律师，专注于交通事故领域）的意见，以便更好地了解自己的权益和维权途径。

可能后果：

• 如果对方驾驶员最终履行了义务，将赔偿款交给了公司，那么问题将得到圆满解决。
• 如果对方驾驶员拒绝履行义务，并且您通过法律途径成功维权，那么对方驾驶员可能需要承担返还赔偿款、赔偿损失等法律责任。
• 如果对方驾驶员的行为构成犯罪（如诈骗等），那么其还可能面临刑事处罚。

进一步行动建议：

• 在采取任何行动之前，请确保您已经充分了解了相关法律法规和程序要求。
• 如果您对法律程序不熟悉或感到困惑，请及时向我咨询，我将为您提供专业的法律指导和帮助。
• 在处理纠纷过程中，请保持与对方的沟通渠道畅通，并尽量通过和平、理性的方式解决问题。