当原单位不同意商调函中的调动申请时，你可以采取以下措施来应对：
理解原单位拒绝的原因：
- 合同约束：首先，检查你与原单位签订的劳动合同，特别是关于服务期限、违约责任等条款。如果合同中有明确规定，且你目前仍在服务期内，原单位有权依据合同拒绝你的调动申请。
- 工作需求：原单位可能因你当前承担的关键项目或团队角色而拒绝调动，担心你的离开会影响项目进度或团队稳定性。
与原单位沟通协商：
- 表达意愿：向原单位明确表达你的调动意愿和职业发展规划，同时说明调动对你个人成长和未来发展的重要性。
- 寻求妥协：尝试与原单位协商，看是否能通过延期调动、兼职、项目合作等方式，在满足原单位工作需求的同时，也实现你的调动目标。
- 了解顾虑：主动询问原单位拒绝调动的具体顾虑，并尝试提出解决方案，以消除或减轻这些顾虑。
与新单位沟通：
- 说明情况：将原单位拒绝调动的情况如实告知新单位，看新单位是否能提供协助或提出其他解决方案。
- 探讨替代方案：与新单位探讨是否有其他形式的合作或入职方式，如先以兼职、顾问等形式加入，待原单位合同到期或项目结束后再正式入职。
法律途径（如必要）：
- 审查合同：如果认为原单位的拒绝违反了劳动合同或相关法律法规，可以仔细审查合同条款，并咨询专业律师（即我，桑文君律师，专注于经济纠纷、合同纠纷领域）以获取法律意见。
- 协商调解：在律师的协助下，可以尝试与原单位进行协商调解，寻求双方都能接受的解决方案。
- 法律诉讼：如果协商调解无果，且确实存在法律纠纷，可以考虑通过法律途径解决，如提起劳动仲裁或诉讼。
准备应对策略：
- 备份计划：在等待调动结果的同时，制定备份计划，如继续在原单位工作、寻找其他工作机会等，以应对可能的不确定性。
- 保持专业态度：无论结果如何，都应保持专业态度，继续履行你在原单位的职责，避免因情绪化行为而影响你的职业声誉。
示例回复函（如需向原单位正式回复）：
关于[新单位名称]商调函的正式回复
[新单位名称]：
贵单位发来的关于我的商调函，我已及时收悉，并对此表示衷心的感谢。然而，经过与原单位的沟通协商，我遗憾地得知，目前原单位无法同意我的调出申请。
我理解原单位因我当前承担的关键项目和团队角色而对我的调动有所顾虑。同时，我也非常珍视这次调动机会，认为它对我个人职业发展和未来规划具有重要意义。
因此，我希望能与贵单位进一步沟通，探讨是否有其他形式的合作或入职方式，如延期调动、兼职、项目合作等。我相信，通过双方的共同努力和协商，我们一定能找到一个既满足贵单位需求，又符合我个人职业发展规划的解决方案。
如有任何疑问或需要进一步交流的事项，请随时与我联系。我将竭诚为您提供必要的支持和协助。
再次感谢贵单位的理解与支持。
此致
敬礼！
[你的姓名]
[具体日期]
在处理此类问题时，保持与原单位和新单位的良好沟通至关重要。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律意见。