结论前置：公司让您提交离职申请，并不意味着您就完全失去了通过法律途径维护自己权益的机会，具体能否起诉取决于多种因素，包括离职的性质、公司的行为以及您所主张的权益等。以下从不同角度为您详细分析：
离职申请的性质：
- 如果您提交的是自愿离职申请，且公司没有采取任何违法或不当行为（如胁迫、欺诈等），那么一般情况下，您可能难以就离职本身提起诉讼。因为自愿离职是您个人意愿的体现，公司通常无需承担法律责任。
- 如果您是在公司胁迫、欺诈或违反法律规定的情况下提交的离职申请，那么您有权提起诉讼，主张公司行为违法，并要求相应的赔偿或恢复劳动关系。例如，公司以降薪、调岗等不正当手段迫使您离职，就可能构成违法解除劳动合同。
公司行为是否违法：
- 即使您提交了离职申请，如果公司在此过程中存在违法行为（如未支付经济补偿金、未办理社保转移手续等），您仍然可以就这些违法行为提起诉讼或申请劳动仲裁。
- 例如，根据《劳动合同法》的规定，用人单位在解除或终止劳动合同时，应当向劳动者支付经济补偿金。如果公司未支付，您就有权要求公司支付，并可以通过法律途径维护自己的权益。
您所主张的权益：
- 您能否起诉还取决于您所主张的具体权益。如果您主张的是与公司解除劳动合同相关的权益（如经济补偿金、未休年假工资等），且这些权益受到法律保护，那么您就有权提起诉讼或申请劳动仲裁。
- 例如，如果您认为公司未按照法律规定支付您经济补偿金，您就可以向劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司支付相应的经济补偿金。
法律建议：
- 在决定是否起诉之前，建议您先与公司进行沟通协商，尝试通过友好方式解决争议。
- 如果沟通无果，您可以咨询专业律师（比如我，祝友良律师，专注于劳动仲裁等领域），了解自己的权益和可能的法律途径。
- 根据律师的建议和您的实际情况，决定是否提起诉讼或申请劳动仲裁，并准备好相关证据材料以支持您的主张。
可能法律后果：
- 如果您提起诉讼或申请劳动仲裁并胜诉，公司可能需要承担相应的法律责任，如支付经济补偿金、赔偿金等。
- 如果您败诉，则可能需要承担诉讼费用等后果。但请记住，即使败诉，也不意味着您的权益没有得到保护，因为法律程序本身就是一个维护权益的过程。
总之，公司让您提交离职申请并不意味着您就完全失去了通过法律途径维护自己权益的机会。具体能否起诉取决于多种因素，包括离职的性质、公司的行为以及您所主张的权益等。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。