三个月绩效一次性扣完通常是不合法的，以下从不同角度进行分析：
法律角度
工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。绩效工资作为工资的一部分，也应当遵循这一原则，按月支付，而非一次性扣除。
绩效工资的性质：
- 绩效工资通常与劳动者的工作表现、业绩等挂钩，是劳动者劳动成果的体现。如果用人单位无正当理由一次性扣除三个月的绩效工资，这实际上是对劳动者劳动成果的否定，违反了劳动法的公平原则。
合法扣除的情形：
- 当然，如果劳动者存在严重违反用人单位规章制度、给用人单位造成重大损失等情形，用人单位可以依据相关规定扣除劳动者的工资，但扣除的部分应当合理，且不得超过法定限额。一次性扣除三个月的绩效工资，显然超出了合理范围。
实际操作角度
劳动合同与规章制度：
- 用人单位在制定劳动合同和规章制度时，应当明确绩效工资的支付方式、扣除条件等。如果劳动合同或规章制度中没有明确规定可以一次性扣除三个月的绩效工资，那么用人单位这样做就是违法的。
劳动者权益保护：
- 劳动者在面对用人单位不合理扣除绩效工资时，应当积极维护自己的权益。可以先与用人单位协商，要求其说明扣除绩效工资的理由和依据。如果协商无果，劳动者可以向当地劳动行政部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的权益。
可能的法律后果
补发工资与赔偿：
- 如果用人单位被认定违法扣除绩效工资，那么劳动者有权要求用人单位补发被扣除的绩效工资，并可能获得相应的赔偿。
行政处罚：
- 劳动行政部门在接到劳动者的投诉后，会对用人单位进行调查。如果确认用人单位存在违法行为，劳动行政部门会依法对其进行行政处罚，如罚款、责令改正等。
建议：
- 劳动者：在面对用人单位不合理扣除绩效工资时，应当保留好相关证据，如工资条、劳动合同、规章制度等，以便在维权时提供有力支持。
- 用人单位：应当严格遵守劳动法律法规，合理制定劳动合同和规章制度，确保劳动者的权益得到保障。同时，在扣除劳动者工资时，应当遵循合法、合理、公正的原则，避免引发劳动纠纷。
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