结论：在老板犯罪而员工并不知情的情况下，员工通常不会承担刑事责任，但可能需要配合司法机关的调查，并在特定情况下承担一定的民事责任。以下是对此问题的详细分析：
一、员工不承担刑事责任的情形
无知情且无参与：
- 如果员工对老板的犯罪行为完全不知情，且没有以任何方式参与、协助或隐瞒这些行为，那么员工无需承担刑事责任。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》的罪刑法定原则，构成犯罪需要行为人实施了相应的客观行为，并具备主观上的罪过（如故意或过失）。员工未实施犯罪行为且无犯罪故意，因此不构成犯罪。
- 实例说明：如非法集资案件中，员工仅按老板要求进行常规工作，对非法集资行为不知情，则通常不被追究刑事责任。
正常工作职责：
- 员工虽然按照老板的指示进行了某些操作或交易，但这些行为在正常的工作职责和业务范围内，且员工没有理由怀疑这些行为涉及违法犯罪。
- 实例说明：财务人员按照老板的正常指示进行账目操作，但不知晓资金非法来源和用途的情况，通常不会被追究刑事责任。
二、员工可能需要配合调查的情况
- 即便员工对老板的犯罪行为不知情，但在司法机关调查过程中，员工仍需积极配合。
- 义务内容：员工有义务如实向司法机关提供其所了解的与案件有关的情况，包括公司的日常运营、老板的工作指令等。如果员工持有与案件相关的文件、资料或电子数据等证据，应当及时交给司法机关，以协助调查。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》规定，知道案件情况的人有作证的义务。
三、员工可能承担责任的特殊情形
过失犯罪：
- 如果员工应当知道老板的行为可能是犯罪行为，却因为疏忽大意没有察觉，或者已经察觉但轻信能够避免危害结果的发生，那么员工可能构成过失犯罪。
- 实例说明：在食品安全案件中，员工从原料的价格、质量等方面应能判断出原料可能存在问题，却仍然按照老板要求生产的情况，可能构成过失犯罪。
实质性帮助：
- 如果员工虽不知情，但在客观上为老板的犯罪行为提供了实质性的帮助（如频繁拨打诈骗电话等），可能会被认定为从犯并承担相应的法律责任。
民事责任：
- 员工在执行老板指令时给他人造成民事损害，尽管对指令的违法性不知情，也可能需要承担一定的民事责任。
- 法律依据：《中华人民共和国民法典》规定，用人单位工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任；但用人单位可向有故意或重大过失的工作人员追偿。
四、员工的应对建议
保持冷静并了解情况：
- 员工应首先保持冷静，通过可靠渠道了解事情全貌，以便做出正确判断。
积极配合调查：
- 如相关部门介入，员工应积极配合调查，如实陈述自己的知情情况和无辜状态。
保护自身权益：
- 在整个过程中，员工应注意保护自己的合法权益，避免不必要的损害。例如，可以保留与案件相关的证据，如工作记录、邮件往来等，以备不时之需。
加强防范意识：
- 平时工作中，员工应保持警惕，注意观察公司运营是否存在异常，及时向上级反映或举报可疑行为。这不仅可以保护自己免受牵连，也有助于维护公司的合法运营和社会的公正秩序。
综上所述，老板犯罪而员工并不知情时，员工通常不会承担刑事责任，但需积极配合调查并如实陈述所知情况。同时，员工应保持警惕，及时发现并报告可疑的违法行为。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更准确的法律意见和帮助。