年薪被扣发是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 合同约定明确且合法的情况：

   • 如果劳动合同或相关协议中明确规定了年薪的构成、支付方式以及扣发的条件和情形，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在符合约定条件的情况下扣发年薪是合法的。例如，合同中约定如果员工严重违反公司规章制度或造成重大经济损失，公司有权扣发部分年薪作为赔偿，且这种约定不违反法律，那么公司在此情况下扣发年薪就是合法的。

2. 合同约定不明确或违法的情况：

   • 如果劳动合同或相关协议中没有明确规定年薪的扣发条件和情形，或者规定的扣发条件违反了法律法规的强制性规定（如无故扣发、以非法目的扣发等），那么用人单位扣发年薪就是违法的。在这种情况下，员工有权要求用人单位支付被扣发的年薪，并可能根据具体情况要求用人单位承担相应的法律责任。

3. 用人单位单方面扣发年薪的情况：

   • 即使劳动合同或相关协议中有关于年薪扣发的规定，但如果用人单位未经员工同意，单方面改变年薪支付方式或扣发年薪，且这种改变或扣发没有合法依据，那么也是违法的。员工可以依法维护自己的权益，要求用人单位支付被扣发的年薪。

法律建议：

• 审查合同：首先，员工应仔细审查自己的劳动合同或相关协议，了解年薪的构成、支付方式以及扣发的条件和情形。
• 沟通协商：如果员工对年薪的扣发有异议，应首先与用人单位进行沟通协商，尝试解决问题。
• 寻求法律援助：如果沟通协商无果，员工可以寻求法律援助，向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，或者向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果用人单位违法扣发年薪，除了需要支付被扣发的年薪外，还可能需要根据具体情况承担赔偿金、滞纳金等法律责任。同时，用人单位的违法行为还可能受到劳动行政部门的处罚。

总之，年薪被扣发是否合法取决于多种因素，包括合同约定、法律法规以及具体情况等。如果你对年薪被扣发有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。