结论：在行政诉讼一审半年多未出判决书，且行政机关又提交了证据的情况下，一审法院是可以进行二次开庭的。

分析说明：

1. 行政诉讼一审的审理期限：

   • 根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，行政诉讼一审的审理期限通常为六个月，但特殊情况可以延长。如果案件复杂或存在其他特殊情况，法院可能会需要更长时间来审理，这并不意味着法院不能继续审理或进行二次开庭。

2. 行政机关提交新证据的情况：

   • 在行政诉讼过程中，如果行政机关在法庭辩论终结前提交了新的证据，法院应当根据案件情况决定是否需要再次开庭进行质证和辩论。这是为了确保双方当事人的诉讼权利得到充分保障，特别是被告行政机关的举证权利。

3. 一审法院二次开庭的合法性：

   • 一审法院在收到行政机关提交的新证据后，有权根据案件需要决定是否再次开庭。这是法院行使审判权的一部分，旨在确保案件的公正、公平审理。因此，一审法院进行二次开庭是合法的，也是必要的，如果新证据对案件结果有重大影响的话。

法律建议：

• 对于原告：如果行政机关提交了新证据，且法院决定进行二次开庭，原告应积极准备，针对新证据进行质证和辩论，以维护自己的合法权益。
• 对于被告行政机关：应确保提交的新证据真实、合法、有效，并符合行政诉讼的举证要求。同时，应积极配合法院的审理工作，尊重法院的审判权。
• 对于双方当事人：在行政诉讼过程中，都应遵守法庭纪律，尊重法官和对方当事人的诉讼权利。如果对于法院的审理程序或判决结果有异议，可以通过合法途径提出上诉或申诉。

后续行动：

• 如果您作为当事人，对一审法院的审理程序或判决结果有疑问或不满，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。
• 同时，您也可以关注法院的审理进度，及时了解案件的最新动态，以便做好相应的准备和应对。