结论：签订停薪留职协议后，若主张协议无效并要求公司补齐工资，其可行性取决于协议的具体内容、签订时的法律环境及双方的真实意愿等多种因素。以下从多个角度进行分析：
一、停薪留职协议的法律效力
协议内容合法性：
- 停薪留职协议若违反法律法规的强制性规定（如最低工资标准、社会保险缴纳等），则可能被认定为无效。例如，若协议中约定员工在停薪留职期间不享受任何工资及福利待遇，且公司不承担社会保险缴纳义务，这样的条款很可能因违反法律强制性规定而无效。
双方真实意愿：
- 协议的签订必须是双方真实意愿的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。若员工在签订协议时受到公司的欺诈或胁迫，导致其在违背真实意愿的情况下签订了协议，那么员工有权主张协议无效。
二、主张协议无效并要求补齐工资的法律依据
《劳动合同法》相关规定：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。但变更劳动合同应当采用书面形式，且变更后的劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。若停薪留职协议实质上变更了原劳动合同的主要内容（如工资、工作岗位等），且未遵循法定程序，那么员工有权主张协议无效，并要求公司按照原劳动合同的约定补齐工资。
《民法典》关于合同无效的规定：
- 根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。若停薪留职协议违反了法律法规的强制性规定，员工同样有权主张协议无效，并要求公司承担相应的法律责任，包括补齐工资。
三、实际操作中的建议
收集证据：
- 员工在主张协议无效并要求补齐工资时，应首先收集相关证据，如停薪留职协议、原劳动合同、工资发放记录、社会保险缴纳记录等，以证明协议的内容、签订过程及公司的违约行为。
协商与调解：
- 在收集到足够证据后，员工可以尝试与公司进行协商或调解，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于节省时间和成本，同时维护双方的劳动关系。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若协商或调解无果，员工可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求裁决协议无效并责令公司补齐工资。若对仲裁结果不服，员工还可以向人民法院提起诉讼，通过司法途径维护自己的合法权益。
四、可能面临的法律后果
若协议被认定无效：
- 若停薪留职协议被认定无效，公司应按照原劳动合同的约定向员工补齐工资，并可能需承担因未缴纳社会保险而产生的法律责任。
若协议被认定有效：
- 若停薪留职协议被认定有效，员工则需按照协议的约定履行自己的义务，无权要求公司补齐工资。但在此情况下，员工仍可就协议中可能存在的其他争议点（如社会保险缴纳等）与公司进行协商或寻求法律救济。
最后，签订停薪留职协议后主张协议无效并要求公司补齐工资是一个复杂的法律问题，涉及多个方面的法律规定和实际操作。因此，在处理此类问题时，建议你直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议和指导。