公司清算时，员工的经济补偿金是按照员工在本单位的工作年限（即通常所说的“工龄”或“司龄”，在此情境下两者一致）来计算的。以下是详细解释：
法律依据与计算标准
法律依据：
- 主要遵循《中华人民共和国劳动合同法》第四十四条、第四十六条、第四十七条的相关规定。根据这些条款，用人单位被依法宣告破产或决定提前解散等情形下，劳动合同终止，且用人单位应向劳动者支付经济补偿。
计算标准：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
工资基数的确定
- 月工资定义：指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入，但不包含加班工资。
- 特殊情况处理：
- 若月平均工资低于当地最低工资标准，则按最低工资标准计算。
- 若月平均工资高于当地职工月平均工资三倍的，经济补偿标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且最高不超过十二年。
工龄的认定与证据提供
- 工龄定义：工龄指劳动者以工资收入为主要生活来源的工作时间。
- 认定依据：劳动合同、社保缴纳记录、工资发放记录等为主要依据。未签订劳动合同的，可提供工作证、考勤记录、证人证言等其他能证明劳动关系的证据来确定工龄。
特殊情况下的经济补偿
额外补偿：
- 如果公司未提前三十日以书面形式通知劳动者本人的，应额外支付一个月工资作为代通知金，计算标准为上一个月的工资。
无需补偿情形：
- 若员工存在《劳动合同法》第三十九条规定的情形（如严重违反规章制度、严重失职等），公司清算时无需支付经济补偿金。
特殊工种与工伤：
- 高风险、重体力等特殊工种的职工，其特殊工种岗位工作年限可合并计算在一般工龄内，享受相应补偿，但需提供工作证明材料。
- 员工患职业病或因工负伤并丧失或部分丧失劳动能力的，除正常工龄补偿外，还应按工伤保险规定支付一次性伤残就业补助金等相关费用。
示例说明
假设某员工在公司工作了5年零8个月，其劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资为8000元，且该工资未超过当地职工月平均工资的三倍。那么，该员工应获得的经济补偿金计算如下：
- 工作年限：5年零8个月，按6年计算。
- 经济补偿金：6年 × 8000元/年 = 48000元。
总结与建议：
公司清算时的员工经济补偿金计算是一个涉及多个法律知识点的复杂过程。为确保员工的合法权益得到充分保障，建议公司在清算过程中严格遵循相关法律法规。同时，员工也应了解自身权益，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。