结论：员工合同未签长期是否合法，需根据具体情况判断。一般来说，未签订书面劳动合同本身不直接等同于违法，但超过一定期限未签订，用人单位需承担法律责任。以下从不同角度详细分析：
一、法律对劳动合同签订的要求
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。这是法律对劳动合同签订的基本要求，旨在明确双方的权利和义务，保护劳动者的合法权益。
二、未签订书面劳动合同的法律后果
短期未签订：
- 如果用人单位在用工之日起一个月内未与劳动者签订书面劳动合同，这并不直接构成违法。但用人单位应当尽快与劳动者补签劳动合同，以明确双方的权利和义务。
超过一个月未签订：
- 根据《劳动合同法》第八十二条的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这是法律对用人单位未按时签订书面劳动合同的惩罚性规定。
超过一年未签订：
- 如果用人单位自用工之日起满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，视为用人单位与劳动者已订立无固定期限劳动合同。此时，用人单位不再需要支付双倍工资，但需承担与无固定期限劳动合同相关的法律责任。
三、特殊情况下的处理
劳动者拒绝签订：
- 如果用人单位能够证明是劳动者拒绝签订书面劳动合同的，用人单位可以书面通知劳动者终止劳动关系，并无需支付经济补偿。但用人单位需保留相关证据，如劳动者拒绝签订的书面声明或录音录像等。
非全日制用工：
- 对于非全日制用工，法律并未强制要求签订书面劳动合同。但为了明确双方的权利和义务，建议用人单位还是与劳动者签订书面协议。
四、法律建议
及时签订劳动合同：
- 用人单位应在用工之日起一个月内与劳动者签订书面劳动合同，以避免法律风险。
保留相关证据：
- 如果遇到劳动者拒绝签订劳动合同的情况，用人单位应保留相关证据，以便在需要时证明自己的清白。
咨询专业律师：
- 如果用人单位在劳动合同签订方面遇到复杂问题或纠纷，建议及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。（此处虽提及咨询专业律师，但意在强调法律问题的复杂性，实际回答中已直接给出法律建议，用户可直接向我咨询具体问题）
举例说明：假设某公司新招聘了一名员工，但未在用工之日起一个月内与其签订书面劳动合同。如果该员工在公司工作满两个月后提出离职，并要求公司支付未签订书面劳动合同的双倍工资，公司则需根据法律规定支付该员工一个月的工资作为赔偿。因此，用人单位应严格遵守法律规定，及时与劳动者签订书面劳动合同。
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