当公司不愿意配合做工伤鉴定时，您作为劳动者完全有权依法维护自己的合法权益。以下是一些详细且有条理的建议，希望能帮助您有效应对这一情况：

一、明确自身权利与自行申请流程

首先，您需要清楚了解，根据《工伤保险条例》的规定，用人单位有义务在职工发生事故伤害或被诊断为职业病后30日内，向社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果公司未能在规定时间内提出申请，您或您的近亲属、工会组织有权在事故伤害发生之日或被诊断为职业病之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区的社会保险行政部门提出工伤认定申请。

二、全面收集并准备申请材料

在自行申请工伤认定时，您需要准备一系列关键材料来支持您的申请，包括但不限于：

1. 工伤认定申请表：详细填写事故发生的时间、地点、原因以及您的伤害程度等基本情况。
2. 劳动关系证明材料：如劳动合同、工资发放记录、工作证、考勤记录或同事的证人证言等，以证明您与用人单位之间的劳动关系。如果缺乏劳动合同，您可能需要先通过劳动仲裁来确认劳动关系。
3. 医疗机构诊断证明：提供受伤后的医疗诊断证明书或职业病诊断证明书（鉴定书），这是证明您工伤情况的重要依据。
4. 其他辅助证据：如医疗记录、事故现场照片、目击者证言等，这些证据可以进一步支持您的工伤主张。

三、向社会保险行政部门提出申请并积极配合调查

携带准备好的申请材料，您应尽快向用人单位所在地统筹地区的社会保险行政部门提出工伤认定申请。社会保险行政部门将在收到申请后15日内对材料进行审核，并可能进行调查核实。在此过程中，您应积极配合调查，如实提供相关信息和证据。如果用人单位拒不协助调查，社会保险行政部门将有权责令其改正，并处以相应的罚款。

四、寻求外部帮助与投诉途径

在工伤认定过程中，如果您遇到法律难题或权益受到严重侵害，不要犹豫寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供具体的法律建议和支持，帮助您更好地维护自己的权益。同时，您也可以选择向当地的劳动监察部门进行投诉，劳动监察部门将对公司的行为进行调查，并采取相应措施来保护您的权益。

五、对认定结果不服的救济途径

如果您对工伤认定结论不服，您有权依法采取救济途径来维护自己的权益。具体来说，您可以在收到工伤认定结论之日起60日内，向作出工伤认定决定的社会保险行政部门的本级人民政府或上一级社会保险行政部门申请行政复议；或者，在收到工伤认定结论之日起6个月内，直接向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。

六、保持冷静与理性，妥善保管证据

在整个过程中，保持冷静和理性至关重要。同时，您应妥善保管好所有与工伤相关的证据材料，包括但不限于医疗记录、事故现场照片、证人证言等。这些证据将在您需要维权时发挥重要作用。

总之，面对公司不愿意配合做工伤鉴定的情况，您应明确自身权利，积极准备申请材料，向社会保险行政部门提出申请，并配合调查。同时，寻求外部帮助、投诉途径以及对认定结果不服的救济途径也是维护自身权益的重要途径。请记住，法律是保护您权益的有力武器，您有权依法维护自己的合法权益。