结论前置：辞职后，用人单位应当一次性付清劳动者全部应得工资，这是法律规定的明确义务。若存在特殊情况或争议，也应按照法律规定进行处理，确保劳动者的合法权益得到保障。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律依据与工资支付义务
根据《工资支付暂行规定》第九条以及《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这些规定旨在保障劳动者在离职后能够及时获得其应得的劳动报酬，防止拖欠工资等侵害劳动者权益的情况发生。
二、工资结算原则与特殊情况处理
结算时间：
- 用人单位应在解除或终止劳动合同时，即员工办理完离职手续当天或按照公司既定的工资发放周期（如每月固定发薪日，但需确保不违反法律规定的一次性付清原则）支付工资。拖延支付属于违法行为。
工资计算：
- 工资应按照员工实际工作天数及相应工资标准准确计算，包括基本工资、绩效工资、奖金、加班工资等。计算标准应与劳动合同约定及公司规章制度相符。例如，月工资为X元，当月实际出勤Y天（假设月应出勤Z天），则工资计算方式可能为：\(工资 = X \div Z \times Y\)（具体根据合同和公司规定调整）。
- 对于加班工资，按照法律规定的加班工资计算标准支付：平时加班按1.5倍、周末加班按2倍、法定节假日加班按3倍计算。
特殊情况处理：
- 若劳动者因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，用人单位可依据劳动合同约定要求其赔偿。但扣除赔偿部分后的工资不得低于当地月最低工资标准，且每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
- 对于工资计算周期和结算方式较为复杂的岗位（如销售提成等），用人单位应明确告知劳动者工资的结算方式和后续发放时间，并严格按照约定执行。若因特殊原因无法立即结清，也应与劳动者协商确定合理的支付期限，并确保不违反法律规定。
三、不同辞职情况下的工资结算
- 正常辞职：劳动者提前通知用人单位（一般是提前30日以书面形式通知，试用期内提前3日通知），辞职到期后，用人单位应结清工资。
- 特殊辞职：如用人单位存在违法情形（如未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社会保险费等），劳动者可随时解除劳动合同，用人单位同样需结清工资。
- 协商一致解除劳动合同：双方可协商工资支付时间和方式，但一般也应在离职时结清，除非有特别约定且该约定不违反法律规定。
四、劳动者维权途径
若用人单位未按规定支付全部应得工资，劳动者可通过以下合法途径维护自身权益：
- 友好协商：首先尝试与用人单位进行友好协商，寻求解决方案。
- 劳动监察投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并责令用人单位支付拖欠的工资。
- 劳动仲裁申请：若劳动监察部门处理不满意或用人单位仍不支付工资，劳动者可依法申请劳动仲裁，通过法律途径维护自身权益。在申请仲裁时，应提供劳动合同、工资条、考勤记录等相关证据以支持自己的主张。
- 提起诉讼：对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼，通过司法途径解决争议。
五、总结与建议
综上所述，辞职后用人单位应当一次性付清劳动者全部应得工资，这是法律规定的明确义务。在特殊情况下，也需按照法律规定进行处理，确保劳动者的合法权益不受侵害。若遇纠纷，劳动者应依法维权，通过友好协商、劳动监察投诉或劳动仲裁申请等途径解决。
建议：在离职前，劳动者应仔细阅读劳动合同和公司规章制度中关于工资支付的规定，确保自己的权益得到保障。同时，在离职时与用人单位确认工资结算情况，并保留好相关证据（如工资条、考勤记录等），以备不时之需。若有问题，可以直接向我咨询。