结论：在合同已完成任务但甲方因流程问题要解除并退回合同款的情况下，能否开红字发票需分情况讨论，主要取决于合同解除的具体性质、双方约定以及税务机关的认定。

1. 若合同解除被认定为“销售退回”或“服务中止”
   根据《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则，若合同解除后，双方确认原交易不再履行（如货物退回、服务未完成），且符合税务机关对“销售退回”或“服务中止”的认定条件，可以开具红字发票。此时需注意：

   • 需取得甲方提供的书面解除协议或证明文件，明确解除原因及退款金额；
     
   • 若原发票已认证抵扣，需由甲方配合向税务机关申请《开具红字增值税专用发票信息表》；
     
   • 退回的合同款应与原发票金额一致，避免出现部分退款导致红字发票金额与实际不符的情况。

2. 若合同解除被认定为“违约赔偿”或“单方解除”
   若甲方因自身流程问题单方解除合同，但原交易已实际完成（如货物已交付、服务已提供），且解除属于违约行为，可能无法直接开具红字发票。此时需区分：

   • 若退款性质为“违约金”或“赔偿款”：根据税法规定，违约金不属于增值税应税范围，无需开具红字发票，但需按“价外费用”处理（若涉及增值税应税项目）；
     
   • 若退款性质为“部分退款”：如因服务未完全达标而部分退款，需与税务机关沟通确认是否符合部分红冲条件，并留存相关证据（如验收单、退款协议等）。

3. 实务操作建议

   • 优先协商：与甲方明确退款性质（是销售退回、违约赔偿还是其他），并在解除协议中注明；
     
   • 留存证据：保存合同、履约证明（如交付单、服务记录）、解除协议、退款凭证等，以备税务检查；
     
   • 咨询税务机关：因各地税务实践可能存在差异，建议提前向主管税务机关确认具体操作要求，避免风险。

总结：能否开红字发票需结合合同解除性质、退款原因及税务机关认定综合判断。建议根据实际情况选择上述方案，并确保操作符合税法规定。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体细节。