针对您提出的“合同约定的义务未完成，但对方已付款，能否开发票”的问题，我们可以从税务法规的角度来进行详细解答。

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务并收取款项时，收款方是有义务向付款方开具发票的。这一规定是税务管理中的基本原则，旨在确保经济活动的透明度和税收的合规性。

现在，我们具体分析您的情况：

1. 合同义务未完成：这指的是合同中约定的某些服务或商品交付尚未全部实现。然而，这并不影响已经发生的经济活动和款项的收付。

2. 对方已付款：这表明付款方已经履行了其支付义务，而收款方也相应地收到了款项。

结合上述两点，我们可以得出以下结论：

• 尽管合同中的某些义务尚未完成，但已经发生的经济活动（即收款行为）是符合开具发票条件的。
• 根据税务法规，收款方在收到款项后，应当向付款方开具发票，以证明经济活动的发生和款项的收付。

因此，即使合同约定的义务未全部完成，但对方已经付款的情况下，您作为收款方是可以并且应当开具发票的。这样做不仅符合税务法规的要求，也有助于维护双方的经济权益和交易透明度。

最后，我们建议您在开具发票时，确保发票的内容与实际发生的经济活动相符，并按照规定的时间和方式向税务机关进行申报和缴纳税款，以避免任何可能的税务风险。