结论：公司仅支付基本工资而未支付绩效工资，却以考核为由扣除基本工资的做法，通常是不合法的。下面我将从多个角度为你详细分析这个问题。
一、工资构成与考核扣款的合法性
工资构成：
- 工资通常由基本工资、绩效工资、奖金、津贴等多个部分组成。基本工资是劳动者提供正常劳动后应得的固定报酬，而绩效工资则与劳动者的工作表现、业绩等挂钩，属于变动报酬。
考核扣款的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 如果公司未与劳动者协商一致，单方面以考核为由扣除基本工资，这种做法是违法的。因为基本工资是劳动者提供正常劳动后应得的固定报酬，不应因考核不合格而被扣除。
二、公司可能存在的违法行为
未足额支付劳动报酬：
- 如果公司扣除基本工资后，实际支付给劳动者的工资低于当地最低工资标准或劳动合同约定的工资标准，那么公司就构成了未足额支付劳动报酬的违法行为。
违反劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了工资构成和支付方式，而公司却违反约定扣除基本工资，那么公司就违反了劳动合同的约定，需要承担相应的法律责任。
三、劳动者的维权途径
与公司协商：
- 劳动者可以先与公司进行协商，要求公司恢复基本工资的支付，并补发被扣除的工资。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理公司的违法行为。
申请劳动仲裁：
- 劳动者还可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付被扣除的工资及相应的经济补偿。
四、特殊情况下的考虑
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了考核不合格可以扣除一定比例的绩效工资（而非基本工资），并且这种规定是合法有效的（即经过了民主程序、公示等），那么在这种情况下，公司扣除绩效工资可能是合法的。但即便如此，扣除的比例和方式也需要符合法律法规的规定，不能随意扩大扣除范围或提高扣除比例。
建议：如果你遇到了公司仅支付基本工资而未支付绩效工资，却以考核为由扣除基本工资的情况，建议你先与公司进行协商，要求公司恢复基本工资的支付并补发被扣除的工资。如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。