结论：两伤意外险不能直接抵扣工伤保险赔偿款，二者性质、目的和赔偿范围均不同，且法律上不允许以商业保险替代工伤保险的法定义务。

具体分析如下：

1. 法律性质不同
   工伤保险属于社会保险范畴，是用人单位的法定义务（《社会保险法》第33条），具有强制性、非营利性和社会共济性。而两伤意外险属于商业保险，是用人单位自愿为员工购买的补充保障，其性质为合同关系，以盈利为目的。法律明确禁止用人单位通过商业保险替代工伤保险（《工伤保险条例》第62条），即使购买了商业保险，仍需补缴工伤保险并承担相应法律责任。

2. 赔偿范围与目的不同
   工伤保险的赔偿项目包括医疗费、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金等，覆盖员工因工受伤后的全面保障，且赔偿标准由法律明确规定。而两伤意外险的赔偿范围和金额取决于保险合同约定，通常仅覆盖部分医疗费用或一次性伤残补助，且可能存在免赔额、比例赔付等限制。二者目的不同：工伤保险旨在保障员工基本权益，商业保险旨在分散用人单位风险，不能相互替代。

3. 法律后果与风险
   若用人单位未依法缴纳工伤保险，员工发生工伤后，所有工伤保险待遇（包括医疗费、伤残补助等）均需由用人单位自行承担（《工伤保险条例》第62条）。即使购买了两伤意外险，保险公司赔付后，员工仍有权要求用人单位补足工伤保险待遇与商业保险赔偿之间的差额。此外，用人单位可能面临劳动监察部门的处罚（如罚款、责令补缴等）。

实务建议：

1. 立即补缴工伤保险：试用期员工同样享有工伤保险权益，用人单位应自用工之日起30日内为其办理社保登记并缴纳工伤保险费。
2. 商业保险作为补充：两伤意外险可作为工伤保险的补充，但需明确告知员工保险性质，避免员工误认为商业保险可替代工伤保险。
3. 完善用工管理：建议用人单位规范用工流程，避免因未缴社保引发劳动纠纷，同时可咨询专业律师制定合规的用工方案。

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