企业申请特殊工时，需要根据所申请的特殊工时类型（综合计算工时制或不定时工作制）以及相关的法律法规进行申请。以下是详细的解答：
一、特殊工时类型及适用条件
综合计算工时制：
- 定义：指因企业生产特点无法执行标准工时制，而采用以周、月、季等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。
- 适用条件：
- 工作性质特殊，无法执行标准工时制。
- 已向职工说明并经工会或职工代表同意。
- 依法经人力资源社会保障部门许可。
- 适用岗位：如交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等需连续作业的岗位，以及地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节和自然条件限制的行业部分岗位。
不定时工作制：
- 定义：指因企业生产特点、工作特殊需要或职责范围关系，无法按标准工作时间衡量或需机动作业的职工所采用的一种工时制度。
- 适用条件：与综合计算工时制类似，也需满足工作性质特殊、已向职工说明并经同意、经人力资源社会保障部门许可等条件。
- 适用岗位：如企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员、部分值班人员等因工作无法按标准工作时间衡量的岗位，以及长途运输人员、出租汽车司机等需机动作业的岗位。
二、申请流程
- 确定实施岗位：企业首先需明确哪些岗位需要实行特殊工时制度。
- 向职工说明：向涉及岗位的职工详细说明申请理由、工作时间和休息休假安排。
- 征得同意：征得企业工会或职工代表（或职工本人）的同意。
- 准备申请材料：包括非标准工时制审批表、申请报告（载明企业基本情况、申请理由、履行民主程序等情况）、职工代表大会的书面意见及公示情况报告等。
- 提交申请：向当地人力资源社会保障部门提交申请许可。
- 取得许可决定书：等待审批结果，取得许可决定书。
- 与劳动者约定：在劳动合同或集体合同中明确约定实行特殊工时制度的相关条款。
三、注意事项
- 企业应确保申请材料的真实性和完整性。
- 在实行特殊工时制度过程中，应遵守相关法律法规，保障职工的合法权益。
- 如需变更或终止特殊工时制度，也需按照相关规定进行申请和审批。
综上所述，企业申请特殊工时需明确申请类型、适用岗位及条件，并按照规定的流程进行申请和审批。同时，在实行过程中应遵守相关法律法规，确保职工的合法权益得到保障。