关于病假超过3个月（含3个月）是否扣工资的问题，结论需分情况讨论，具体如下：

1. 医疗期内的工资支付标准
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》及部分地方性法规（如《江苏省工资支付条例》），医疗期内企业需按一定比例支付病假工资，不得低于当地最低工资标准的80%。

   • 医疗期长度：根据工龄和单位工作年限，医疗期通常为3-24个月（例如：实际工作10年以下、本单位工作5年以下的，医疗期为3个月）。
     
   • 工资计算：若员工处于医疗期内（如3个月病假属于医疗期范围），企业应按上述标准支付工资，不得全额扣除。
     示例：某地最低工资标准为2000元/月，则医疗期内病假工资不得低于1600元/月。

2. 医疗期满后的工资支付
   若病假超过医疗期（如3个月病假已超出法定医疗期），企业可按以下规则处理：

   • 停止病假工资：医疗期满后，若员工仍无法返岗且未提供劳动能力鉴定证明，企业可停止支付病假工资，改发生活费（标准由地方规定，通常低于最低工资）。
     
   • 解除合同补偿：若企业因员工医疗期满不能工作而解除合同，需支付经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。
     示例：员工医疗期3个月后仍无法工作，企业可停发病假工资，若选择解除合同，需支付N个月工资作为补偿（N为工作年限）。

3. 地方性规定的差异
   部分地区对病假工资有更详细的规定，例如：

   • 上海：医疗期内病假工资按连续工龄分段计算（如6个月以下工龄的，支付60%工资）。
     
   • 北京：医疗期内工资不得低于最低工资标准的80%，医疗期满后按事假处理（无工资）。
     建议：需结合员工所在地具体法规判断，避免一刀切处理。

法律风险提示：

• 企业若未按规定支付医疗期工资，可能面临劳动仲裁赔偿风险。
  
• 员工若虚构病情骗取病假，企业可依据规章制度解除合同，但需保留医疗证明等证据。

行动建议：

1. 核对员工工龄及单位工作年限，确定医疗期长度；
   
2. 查阅当地病假工资支付细则，明确支付比例；
   
3. 若病假超医疗期，与员工沟通返岗或劳动能力鉴定事宜，避免违法解除。
   

如有进一步疑问（如具体地区规定或操作细节），可直接向我咨询。