医院违规发放绩效工资，工作人员可依据《事业单位人事管理条例》《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》（如医院适用劳动合同制）及相关地方性法规、医院内部规章制度等要求处理，具体需结合违规情形和人员身份确定。以下从不同角度展开分析：

一、若医院属于事业单位，工作人员为事业编制人员

1. 处理依据：主要依据《事业单位人事管理条例》第三十二条：“国家建立激励与约束相结合的事业单位工资制度。事业单位工作人员工资包括基本工资、绩效工资和津贴补贴。事业单位工资分配应当结合不同行业事业单位特点，体现岗位职责、工作业绩、实际贡献等因素。”若医院违规发放绩效工资，如未按照岗位职责、工作业绩等合理分配，或存在克扣、拖欠等情况，工作人员可向医院上级主管部门（如卫生健康委员会）反映，要求其进行调查处理。
2. 具体条款：若医院的行为违反了事业单位工资管理的相关规定，上级主管部门可根据《事业单位工作人员处分暂行规定》等相关规定，对医院相关责任人进行处分，并责令医院纠正违规行为，补发应发的绩效工资。

二、若医院与企业类似，工作人员为劳动合同制员工

1. 处理依据：依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”绩效工资属于劳动报酬的一部分，医院违规发放绩效工资，如未按照劳动合同约定或医院规章制度规定的标准发放，工作人员可先与医院协商解决；协商不成的，可向劳动争议调解组织申请调解，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
2. 具体条款：根据《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》第三条：“用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，以及拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬的，除在规定的时间内全额支付劳动者工资报酬外，还需加发相当于工资报酬百分之二十五的经济补偿金。”若医院存在克扣、拖欠绩效工资的情况，工作人员在要求医院补发工资的同时，还可要求医院支付经济补偿金。

三、若医院有内部规章制度对绩效工资发放有明确规定

1. 处理依据：医院内部规章制度是医院与工作人员之间约定权利义务的重要依据。若医院违反内部规章制度发放绩效工资，工作人员可依据规章制度的规定，要求医院按照规定发放绩效工资。
2. 具体条款：具体需查看医院内部规章制度中关于绩效工资发放的条款，如发放标准、发放时间、发放条件等。若医院未按照这些条款执行，工作人员可向医院人事部门或相关领导反映，要求其纠正违规行为。

建议：工作人员在处理此类问题时，应先收集相关证据，如劳动合同、医院规章制度、工资条、银行流水等，以证明医院存在违规发放绩效工资的行为。同时，可根据自身情况选择合适的处理方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等。如有进一步疑问，可直接向我咨询。