针对您提出的“两人合作单位的地和厂房被占”的问题，我理解您主要关心的是在合作经营模式下，遇到土地和厂房被侵占时，应如何维护自身权益。以下是详细的分析和建议：

1. 明确合作性质与权益归属

   • 首先，需要明确您与合作伙伴之间的合作性质，是合伙企业、公司制企业还是其他形式的合作。不同的合作形式，其权益归属和责任承担方式有所不同。
   • 确认土地和厂房的产权归属。如果土地和厂房是合作单位所有，那么您和合作伙伴作为共同所有者，有权共同维护其不被侵占。如果土地和厂房是租赁或借用，则需要查看相关合同，确认租赁或借用期限、条件及违约责任。

2. 收集证据，评估损失

   • 收集被侵占土地和厂房的相关证据，包括但不限于产权证明、租赁合同、现场照片、视频等。
   • 评估被侵占造成的损失，包括直接损失（如土地和厂房的租金损失、被毁坏的财物价值）和间接损失（如因被侵占导致的生产中断、业务损失等）。

3. 与侵占方协商

   • 在掌握充分证据和评估损失后，可以尝试与侵占方进行协商，要求其停止侵占行为，并赔偿因此造成的损失。
   • 协商过程中，可以邀请第三方（如当地村委会、居委会或调解机构）参与，以增加协商的公正性和有效性。

4. 寻求法律途径解决

   • 如果协商无果，您可以和合作伙伴一起，考虑通过法律途径解决。具体可以选择以下方式：
     • 提起民事诉讼：向法院提起民事诉讼，要求侵占方停止侵占、返还土地和厂房，并赔偿损失。在诉讼过程中，需要提供充分的证据支持自己的主张。
     • 申请仲裁：如果合作合同中有仲裁条款，或者双方事后达成仲裁协议，可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁结果具有法律效力，且通常比诉讼程序更为快捷。
     • 报警处理：如果侵占行为涉嫌违法犯罪（如故意毁坏财物、非法侵入住宅等），可以向公安机关报案，要求追究侵占方的刑事责任。

5. 加强后续防范

   • 在解决当前问题的同时，还需要考虑如何加强后续防范，避免类似事件再次发生。例如，可以加强土地和厂房的安保措施，或者与当地政府、社区建立更紧密的联系，以便在出现问题时能够及时得到支持和帮助。

在处理此类问题时，建议您和合作伙伴保持沟通，共同决策，以确保权益得到最大程度的维护。如果您在处理过程中遇到任何法律难题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。