若土地被公司非法占用，您可以通过以下途径维护自身权益：
确认占用性质与证据收集
- 非法占用：若公司未经合法审批（如未取得土地使用权证、未签订租赁/承包合同）或超出约定范围占用土地，属于侵权行为。需收集证据包括：土地权属证明（如土地证、承包合同）、现场照片/视频、证人证言、政府公示文件等。
- 合法占用但存在纠纷：若公司通过合法程序取得土地使用权（如政府征收、租赁合同），但存在补偿不足、程序违法等问题，需针对具体争议点收集证据（如征收公告、补偿协议、评估报告等）。
协商与行政投诉
- 协商解决：优先与公司沟通，明确要求停止侵权、恢复原状或赔偿损失。协商时建议书面记录过程（如发送律师函、签订和解协议）。
- 行政投诉：向当地自然资源部门（原国土局）或农业农村部门举报非法占用行为，要求行政机关介入调查并责令公司退还土地。若涉及污染或破坏耕地，可同步向环保部门投诉。
民事诉讼途径
- 起诉侵权：若协商、投诉无果，可向法院提起民事侵权诉讼，主张公司停止侵害、排除妨碍、赔偿损失（如土地收益损失、恢复费用等）。需注意：
- 诉讼时效为3年，自知道权益受损之日起计算；
- 若土地为集体所有，需以集体经济组织名义起诉，或经村民会议授权由村民代表起诉。
- 确认合同无效：若公司占用基于无效合同（如未经村民同意的租赁合同），可起诉要求确认合同无效并返还土地。
刑事报案（若涉嫌犯罪）
- 若公司通过伪造文件、贿赂等手段非法占用土地，可能构成非法占用农用地罪（破坏耕地10亩以上或基本农田5亩以上）或非法转让、倒卖土地使用权罪。可向公安机关报案，追究刑事责任。
特殊情形处理
- 政府征收项目：若土地被纳入征收范围，但公司提前占用或补偿未到位，可要求政府履行征收程序（如发布征收公告、组织听证、公平补偿）。对补偿标准有异议的，可申请行政复议或提起行政诉讼。
- 历史遗留问题：若土地权属存在争议（如未确权、继承纠纷），需先通过行政确权或民事继承诉讼明确权属，再主张权利。
行动建议：
- 尽快委托律师介入，制定针对性策略（如发送律师函、提起诉讼或行政复议）；
- 避免自行采取过激行为（如强行阻拦施工），可能涉嫌违法；
- 关注土地现状，防止公司进一步破坏或转移资产，必要时申请法院财产保全。
如有具体细节（如占用方式、土地性质、证据情况等），可进一步向我说明，我会为您分析具体操作路径。