首先，作为你注册公司的厂房被他人占用，这是一个比较复杂的法律问题，涉及到物权、合同以及可能的侵权行为。以下是我根据你的情况给出的一些建议：

1. 明确占用性质：

   • 首先，你需要弄清楚占用你厂房的是谁，以及他们占用的法律依据或合同基础是什么。如果是基于某种合同关系（如租赁合同、借用合同等），你需要审查该合同的合法性、有效期以及是否存在违约行为。
   • 如果占用者没有合法的依据或合同基础，那么他们的行为可能构成侵权，你可以考虑采取法律手段来维护自己的权益。

2. 采取法律措施：

   • 如果占用者是基于合同关系占用厂房，但存在违约行为（如未按时支付租金、超期占用等），你可以根据合同条款向法院提起诉讼，要求占用者承担违约责任，包括腾退厂房、支付违约金等。
   • 如果占用者没有合同依据或法律依据，你可以直接向法院提起侵权诉讼，要求他们停止侵权行为，腾退厂房，并赔偿你因此遭受的损失。

3. 与占用者协商：

   • 在采取法律措施之前，你也可以尝试与占用者进行协商，了解他们的需求和困难，看是否能够通过和解的方式解决纠纷。有时候，通过协商达成和解可以避免长时间的诉讼过程，减少双方的损失。

4. 寻求专业帮助：

   • 在处理这类纠纷时，你可能需要寻求专业的法律帮助。你可以咨询我这样的专业律师，了解具体的法律程序和诉讼策略，以确保你的权益得到有效维护。

综上所述，面对厂房被他人占用的情况，你需要先明确占用的性质和法律依据，然后采取适当的法律措施或协商方式来解决问题。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。