针对您提出的问题，即一个单位内两个部门，一个部门正常发放加班费而另一个部门加班费延迟发放是否可行，我们可以从法律和公平性的角度进行详细分析。

首先，从法律层面来看，加班费是劳动者因加班而应得的劳动报酬，用人单位有义务按时足额支付。根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，用人单位安排劳动者加班的，应当按照法定标准支付加班费。这一规定并未对单位内部的不同部门作出区别对待，因此，从法律原则上讲，所有部门的加班费都应当按时发放，不存在部门间的差异。

其次，从公平性的角度考虑，同一单位内的不同部门应当享有同等的劳动权益。如果因为部门差异而延迟发放加班费，这可能会引发部门间的不公平感和不满情绪，进而影响员工的工作积极性和团队凝聚力。长期来看，这种不公平的待遇还可能对单位的整体运营和企业文化产生负面影响。

再者，如果确实存在特殊情况导致某个部门的加班费需要延迟发放（如财务流程、资金调配等），用人单位应当及时与员工进行沟通，说明原因，并给出明确的发放时间表。这样可以减少员工的疑虑和不满，维护良好的劳动关系。

最后，需要强调的是，无论何种原因导致的加班费延迟发放，用人单位都应当承担相应的法律责任。如果员工因此提起劳动争议仲裁或诉讼，用人单位可能需要支付加班费、滞纳金甚至赔偿金等额外费用。

综上所述，一个单位内两个部门在加班费发放上应当保持一致性和公平性，避免因为部门差异而引发不必要的劳动争议和负面影响。如果确实存在特殊情况需要延迟发放加班费，用人单位应当及时与员工沟通并给出明确的解决方案。