在仲裁确认劳动关系的申请中，一般不建议同时写两个公司名字，但特殊情况下可以视情况处理。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般原则：一个申请对应一个被申请人

在劳动仲裁中，确认劳动关系的申请通常遵循“一个申请对应一个被申请人”的原则。这是因为劳动关系的确认需要明确双方主体，即劳动者和用人单位。如果同时列出两个公司作为被申请人，可能会引发以下问题：

1. 主体不明确：仲裁机构可能难以确定哪个公司是真正的用人单位，从而影响仲裁效率和结果。
2. 法律关系复杂：如果劳动者与两个公司都存在某种形式的联系（如关联公司、劳务派遣等），但并未同时与两个公司建立劳动关系，那么同时列出两个公司可能会使法律关系变得复杂，增加仲裁难度。

二、特殊情况：可以视情况处理

尽管一般原则是一个申请对应一个被申请人，但在某些特殊情况下，如果劳动者确实与两个公司都存在劳动关系，或者存在其他特殊情况（如关联公司混同用工、劳务派遣中用工单位与派遣单位责任不明确等），那么可以考虑在仲裁申请中同时列出两个公司作为被申请人。不过，这种情况下需要特别注意以下几点：

1. 证据充分：劳动者需要提供充分的证据来证明自己与两个公司都存在劳动关系，或者证明两个公司在用工过程中存在混同、责任不明确等情况。
2. 明确诉求：在仲裁申请中，劳动者需要明确自己的诉求，即要求确认与哪个公司存在劳动关系，或者要求两个公司共同承担某种责任。
3. 仲裁机构审查：仲裁机构会对劳动者的申请进行审查，如果认为同时列出两个公司作为被申请人不符合法律规定或仲裁程序要求，可能会要求劳动者进行修正或选择其中一个公司作为被申请人。

三、法律建议

1. 谨慎选择被申请人：在提起仲裁申请前，劳动者应仔细分析自己与各个公司之间的关系，谨慎选择被申请人。如果确实存在与多个公司有关联的情况，建议先咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的法律后果。
2. 准备充分证据：无论选择哪个公司作为被申请人，劳动者都需要准备充分的证据来支持自己的主张。这包括但不限于劳动合同、工资单、工作证、考勤记录等。
3. 遵循仲裁程序：在提起仲裁申请后，劳动者应遵循仲裁机构的程序要求，按时参加仲裁活动，积极配合仲裁机构的工作。

如果您在劳动关系确认方面遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和帮助。