结论：在申请劳动仲裁期间仍继续在公司工作，你需要注意保留证据、遵守公司规章制度、关注仲裁进展，并考虑是否需要调整工作状态。以下是对此问题的详细分析：

一、保留证据，以备仲裁之需

在申请劳动仲裁期间，你仍然在公司工作，这意味着你需要继续收集与劳动争议相关的证据。这些证据可能包括但不限于：工资条、考勤记录、工作邮件、聊天记录、公司规章制度、劳动合同等。这些证据将有助于你在仲裁过程中证明自己的主张，如工资拖欠、加班未补偿、违法解雇等。

举例：如果你主张公司未支付加班费，那么你需要提供加班的考勤记录、工作邮件或聊天记录等证据，以证明你确实加班了，并且公司未支付相应的加班费。

二、遵守公司规章制度，避免被反诉

在仲裁期间，你仍然需要遵守公司的规章制度，按时上下班，完成工作任务。如果你因为仲裁而故意违反公司规定，如旷工、迟到早退、不完成工作任务等，公司可能会以此为由对你进行处罚，甚至解雇你。在这种情况下，你可能会面临被反诉的风险，即公司可能会以你违反规章制度为由，在仲裁中提出反请求，要求你承担相应的责任。

法律背景：根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者在仲裁期间应当遵守法律法规和公司规章制度，不得有损害公司利益的行为。

三、关注仲裁进展，及时应对

在仲裁期间，你需要密切关注仲裁的进展情况，包括仲裁庭的组成、开庭时间、仲裁结果等。如果仲裁庭要求你提供补充证据或进行陈述，你需要及时响应，并按照要求提供相关材料或进行陈述。同时，你也可以主动与仲裁庭联系，了解仲裁的进展情况，以便及时调整自己的策略。

建议：你可以设置提醒或委托亲友关注仲裁进展，以确保不会错过任何重要的通知或要求。

四、考虑是否需要调整工作状态

在仲裁期间，你可能会面临一定的心理压力和工作压力。如果你觉得继续在公司工作会让你感到不适或影响你的仲裁准备，你可以考虑调整自己的工作状态，如申请休假、调岗或暂时离职等。然而，这需要根据具体情况来决定，并需要权衡利弊。

法律后果：如果你选择暂时离职或调岗，你需要确保你的离职或调岗是合法的，并且不会影响你的仲裁结果。例如，如果你因为仲裁而擅自离职，公司可能会以你旷工为由解雇你，并拒绝支付经济补偿。

特殊情况说明：如果你担心在公司继续工作会受到不公正待遇或报复，你可以向仲裁庭提出申请，要求公司不得对你进行报复或歧视。仲裁庭会根据具体情况作出相应的裁决。

如果你有任何关于劳动仲裁的疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。