结论前置：总公司故意辞退分公司大部分员工，只留一个人的行为是否违法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 辞退行为的合法性判断：

   • 合法辞退：如果总公司辞退分公司员工的行为是基于合理的商业考虑，如业务调整、组织架构优化等，并且遵循了《劳动合同法》的相关规定，如提前通知、支付经济补偿等，那么这种辞退行为可能是合法的。但在此情况下，仅留一个人并不直接决定其合法性，关键在于辞退程序和补偿是否合法。
   • 违法辞退：如果总公司辞退分公司员工的行为缺乏合理依据，或者未遵循《劳动合同法》的相关规定，如未提前通知、未支付经济补偿、存在歧视性辞退等，那么这种辞退行为就是违法的。特别是如果总公司故意通过辞退大部分员工来达到某种不正当目的，如逃避法律责任、损害员工权益等，那么这种行为更可能构成违法。

2. 分公司与总公司的法律关系：

   • 分公司作为总公司的分支机构，其民事责任由总公司承担。因此，总公司对分公司的员工辞退行为，实际上也是对分公司民事责任的一种体现。如果总公司辞退行为违法，那么分公司也可能因此承担相应的法律责任。
   • 但需要注意的是，分公司虽然不具有独立法人资格，但在劳动法律关系中，分公司可以作为用人单位与员工签订劳动合同、支付工资、缴纳社会保险等。因此，在处理辞退纠纷时，也需要考虑分公司与员工之间的具体劳动法律关系。

3. 员工权益保护：

   • 无论总公司辞退行为是否合法，员工都有权要求总公司或分公司按照《劳动合同法》的规定支付经济补偿、未休年假工资、加班费等应得权益。
   • 如果员工认为自己的权益受到侵害，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求总公司或分公司承担相应的法律责任。在仲裁过程中，员工需要提供相关证据来证明自己的主张，如劳动合同、工资单、辞退通知等。

4. 具体建议：

   • 对于被辞退的员工来说，首先应该了解自己的权益和法律规定，然后与公司进行协商，要求公司按照法律规定支付相应的补偿和权益。
   • 如果协商无果，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的权益。
   • 在整个过程中，员工可以寻求专业律师的帮助，以便更好地了解自己的权益和法律规定，以及如何有效地维护自己的权益。

进一步思考：在实际操作中，总公司辞退分公司员工的行为可能涉及多种复杂因素，如公司战略调整、业务重组、员工绩效等。因此，在判断其是否违法时，需要综合考虑各种因素，并依据相关法律法规进行具体分析。如果您或您身边的人遇到了类似问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。