针对您提出的问题，即拥有门诊病历和医院开的休假证明，但辞职时厂里不批准的情况，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同，这是《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条的明确规定。这一规定意味着，只要您按照法定程序提前通知了用人单位，您的离职请求在到达用人单位时即发生法律效力，无需用人单位的批准。
针对您目前的情况，虽然您拥有门诊病历和医院开的休假证明，但这并不影响您按照法定程序提出离职。您应该：
提前三十日以书面形式向用人单位提出离职申请：确保您的离职申请明确、具体，并注明离职日期。您可以选择将离职申请直接交给用人单位的人事部门、办公室或法定代表人，并保留好相关的送达证据，如挂号信、邮政速递的底单等，以防用人单位拒绝签收。
做好工作交接：在离职前的一个月内，您需要按照双方约定，做好业务交接、工作物品返还等工作，确保不影响用人单位的正常业务开展。
应对用人单位的不批准：如果用人单位以各种理由（如招不到人接替、您正在休假等）拒绝批准您的离职申请，您无需过分担忧。因为按照法律规定，您已经履行了提前通知的义务，到期后即可离职。如果用人单位不出具离职证明，您可以向当地劳动监察部门投诉，或者向用人单位所在地劳动人事争议仲裁委员会提起劳动仲裁，要求用人单位出具离职证明并可能要求赔偿因未出具离职证明而给您造成的损失。
注意特殊情况：虽然一般情况下劳动者可以提前三十日通知离职，但也有一些特殊情况需要注意。例如，如果用人单位为您提供了专项培训费用，并对您进行了专业技术培训，且双方约定了服务期，那么您在未满服务期的情况下辞职，可能需要按照约定向用人单位支付违约金。不过，这并不影响您按照法定程序提出离职的权利，只是可能需要承担一定的经济责任。
综上所述，您拥有门诊病历和医院开的休假证明并不影响您按照法定程序提出离职。只要您提前三十日以书面形式通知用人单位，并做好工作交接，到期后即可离职。如果用人单位不批准或不出具离职证明，您可以采取相应的法律措施来维护自己的权益。