针对您提出的“设施农用地不备案怎么办”的问题，我将从设施农用地的性质、管理方式以及未备案的查处措施三个方面，为您进行详细解答。

首先，我们来了解一下设施农用地的性质。设施农业用地是农业生产中直接用于作物种植和畜禽水产养殖的设施用地，它包括作物生产设施用地、为生产服务的看护房、农资农机具存放场所等，以及畜禽水产养殖生产及直接关联的粪污处置、检验检疫等设施用地。这些用地按农用地管理，不需办理农用地转用审批手续，但严禁占用基本农田，可以使用一般耕地，并需落实进出平衡。

接下来，我们谈谈设施农用地的管理方式。在过去，占用一般耕地搞养殖项目，政策相对宽松，只需乡镇备案即可。然而，随着政策的收紧，现在对于占用一般耕地搞养殖项目，不仅要求“批准”，还需符合相关标准，并且最关键的是要上图入库。备案工作由乡镇负责，而上图入库则由自然资源部门负责。如果只是备案了但没有上图入库，在管理中是不予认可的。

那么，对于未备案的设施农用地，我们应该如何处理呢？

1. 对于确实属于设施农业项目但未办理设施农用地手续的：

   • 应当责令当事人限期完善设施农用地手续。
   • 如果拒不办理，其附属设施用地、配套设施用地等改变农用地性质的部分，将视为违法建设用地，并依照《土地管理法》有关规定依法查处。
   • 未改变农用地性质的部分，则不属于违法建设用地。

2. 对于已经办理设施农用地使用手续但附属设施用地、配套设施用地超过规定比例和面积标准的：

   • 超过部分改变农用地性质的，属于违法建设用地，应当责令其限期改正。
   • 如果拒不改正，将按照违法用地依法查处。

3. 对于已经办理设施农用地使用手续但涉及非农业建设用地的：

   • 如经营性粮食存储、加工和农机农资存放、维修场所，以及以农业为依托的休闲观光度假场所等，如果未依法办理建设用地审批手续，将视为违法建设用地，并依法查处。

4. 对于以设施农业项目建设为名擅自改变用途从事非农业建设占用土地的：

   • 这将视为违法建设用地，并依据《土地管理法》第七十七条规定按非法占地行为依法严肃查处。

综上所述，设施农用地未备案是一个需要严肃对待的问题。为了确保农业生产的合法性和可持续性，建议您尽快按照相关规定办理设施农用地备案手续，并确保所有设施用地符合政策要求。如果您在办理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询当地乡镇政府或自然资源部门。