设施农用地备案后超过一年未建设，可能面临备案失效、土地闲置处理或需重新履行审批程序等后果，具体需结合地方政策及合同约定处理。以下是详细分析：

1. 备案失效风险
   根据《自然资源部、农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》（自然资规〔2019〕4号）及地方实施细则，设施农用地备案通常设定有效期（多为1-2年）。若超过备案期限未动工建设，备案可能自动失效，需重新向乡镇政府或自然资源部门申请备案，否则可能被认定为非法用地。

2. 土地闲置处理
   若土地已通过划拨或出让方式取得使用权，超过一年未建设可能触发《土地管理法》第38条关于“闲置土地”的规定：

   • 非耕地：闲置满1年，需缴纳土地闲置费（一般为出让金或划拨价款的20%）；
     
   • 耕地：若未恢复种植条件，可能面临行政处罚（如罚款、限期整改）。
     注：具体处罚标准以地方性法规为准，例如《广东省闲置土地处理办法》对闲置耕地的处罚更严格。

3. 合同违约责任
   若备案涉及与村集体或第三方签订的土地租赁/合作协议，超期未建设可能构成违约，需承担：

   • 支付违约金（按合同约定）；
     
   • 赔偿对方实际损失（如土地机会成本、预期收益等）；
     
   • 合同可能被解除，需返还土地并恢复原状。

4. 行政审批程序重启
   部分地区要求设施农用地项目需同步办理规划、环保等审批手续。若备案失效，需重新提交材料并履行审批流程，可能涉及：

   • 补充环境影响评价、用地规划许可等文件；
     
   • 重新公示并征求利害关系人意见；
     
   • 延长项目整体周期，增加成本。

建议行动步骤：

1. 核查备案文件：确认备案有效期及地方具体规定；
   
2. 评估土地现状：若已动工但未完工，可申请延期备案；
   
3. 协商解决方案：与土地出让方/村集体沟通，争取宽限期或调整合同条款；
   
4. 启动建设或复垦：尽快动工或恢复土地原用途，避免进一步法律风险。
   

如有具体案例或地方政策疑问，可进一步提供细节，我将结合实际情况为您分析。