结论：经人民调解委员会调解达成的协议还款履行期限已过，在符合一定条件下仍然可以申请司法确认。
申请司法确认的基本条件
根据《中华人民共和国人民调解法》第三十三条：“经人民调解委员会调解达成调解协议后，双方当事人认为有必要的，可以自调解协议生效之日起三十日内共同向人民法院申请司法确认，人民法院应当及时对调解协议进行审查，依法确认调解协议的效力。人民法院依法确认调解协议有效，一方当事人拒绝履行或者未全部履行的，对方当事人可以向人民法院申请强制执行。人民法院依法确认调解协议无效的，当事人可以通过人民调解方式变更原调解协议或者达成新的调解协议，也可以向人民法院提起诉讼。”
从这一条款可以看出，申请司法确认的时间限制是自调解协议生效之日起三十日内。然而，这一规定并未直接说明如果还款履行期限已过，是否还能申请司法确认。
还款履行期限已过的情况分析
调解协议生效后三十日内申请：
- 如果还款履行期限在调解协议生效后的三十日内，且双方当事人在这一期限内共同向人民法院申请了司法确认，那么无论还款是否已经履行，人民法院都会对调解协议进行审查并确认其效力。
还款履行期限超过调解协议生效后三十日：
- 这种情况下，虽然还款履行期限已经过了，但如果双方当事人仍然希望确认调解协议的效力，理论上仍然可以尝试向人民法院申请司法确认。不过，此时可能面临的问题是，人民法院可能会以超过申请期限为由不予受理。但这并非绝对，因为法律并未明确规定超过三十日后就不能申请，只是强调了“应当”在三十日内申请。
- 实际上，如果双方当事人能够就延迟申请的原因达成一致，并且向人民法院说明情况，人民法院在审查后认为调解协议仍然有效且符合确认条件的，仍有可能确认调解协议的效力。
还款履行期限与调解协议效力确认的关系：
- 还款履行期限是调解协议中的一个重要条款，但它并不直接影响调解协议的效力确认。调解协议的效力确认主要关注的是协议的内容是否合法、双方当事人的意思表示是否真实等。
- 因此，即使还款履行期限已过，只要调解协议本身合法有效，且双方当事人仍然希望确认其效力，就可以尝试向人民法院申请司法确认。
实际操作建议
- 及时沟通：如果还款履行期限已过，且双方当事人仍然希望确认调解协议的效力，建议尽快与对方沟通，达成一致意见后共同向人民法院申请司法确认。
- 准备充分材料：在申请司法确认时，需要准备调解协议、双方当事人的身份证明、申请书等材料。如果可能的话，还可以准备一些能够证明调解协议合法性和有效性的证据材料。
- 咨询专业律师：由于司法确认涉及法律程序和法律效力的确认，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详细的法律建议。