有了调解书后新立的协议，在一定条件下是可以进行司法确认的。以下是对这一问题的详细分析：
一、司法确认的基本条件
司法确认通常指的是对调解协议等法律文书的效力进行确认，使其具有强制执行力。根据相关法律法规，进行司法确认一般需要满足以下条件：
- 调解协议的真实性：调解协议必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 调解协议的合法性：调解协议的内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
- 调解协议的自愿性：双方当事人在签订调解协议时，必须是在自愿的基础上进行的，没有受到任何不当影响。
二、新立协议与调解书的关系
在有了调解书后，双方又新立了协议，这通常意味着双方对原调解书中的某些内容进行了修改或补充，或者达成了新的共识。这种情况下，新立的协议是否可以进行司法确认，取决于以下几个因素：
- 新立协议的内容：如果新立协议的内容与原调解书的内容不冲突，且符合司法确认的基本条件，那么新立协议是可以进行司法确认的。
- 双方当事人的意愿：双方当事人需要就新立协议进行司法确认达成一致意见，并共同向法院提出申请。
- 法院的审查：法院会对新立协议进行审查，确认其是否符合司法确认的条件。如果符合，法院会出具确认裁定书，使新立协议具有强制执行力。
三、实际操作中的注意事项
- 确保协议内容的明确性：新立协议的内容应该明确、具体，避免出现模糊不清或容易产生歧义的条款。
- 保留相关证据：在签订新立协议时，双方应该保留好相关证据，如调解书、新立协议的文本、双方当事人的身份证明等，以备法院审查时使用。
- 及时申请司法确认：如果双方希望新立协议具有强制执行力，应该及时向法院提出司法确认申请，避免因为时间拖延而导致证据丢失或协议内容发生变化。
四、可能遇到的法律后果
- 如果新立协议符合司法确认条件：法院会出具确认裁定书，使新立协议具有强制执行力。这意味着如果一方不履行协议内容，另一方可以向法院申请强制执行。
- 如果新立协议不符合司法确认条件：法院会驳回双方的申请，新立协议将不具有强制执行力。此时，双方可能需要通过其他途径解决纠纷，如重新协商、提起诉讼等。
建议：在有了调解书后新立协议时，双方应该谨慎对待协议内容，确保符合司法确认的基本条件。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。