结论前置：发包方在明确知道承包方是挂靠资质的情况下仍与其签订合同，该合同通常是无效的。这一结论主要基于法律法规的强制性规定以及建设工程领域的特殊要求。
法律依据与分析
法律法规的强制性规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。在建设工程领域，承包方必须具备相应的资质，这是法律对承包方承接工程的基本要求，旨在确保工程质量和施工安全，维护社会公共利益。
- 《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第一条也明确规定，没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义签订的建设工程施工合同，应当认定无效。
建设工程领域的特殊要求：
- 建设工程领域对承包方的资质要求尤为严格，因为这直接关系到工程的质量和安全。如果允许无资质或挂靠资质的承包方承接工程，将严重损害市场秩序和公共利益。
- 发包方在明知承包方无资质或挂靠资质的情况下仍然与其签订合同，这种行为不仅违反了法律法规的强制性规定，也违背了诚实信用原则，因此所签订的合同通常会被认定为无效。
合同无效后的处理与法律后果
合同无效的处理：
- 虽然合同无效，但如果建设工程经验收合格，承包方可以请求参照合同关于工程价款的约定折价补偿。这是因为，尽管合同无效，但承包方已经实际完成了工程建设，且工程质量符合要求，因此有权获得相应的报酬。
- 如果建设工程经验收不合格，修复后验收合格的，发包方可以请求承包方承担修复费用；修复后仍验收不合格的，承包方无权请求折价补偿。这是因为，承包方作为工程的建设者，有责任确保工程质量符合要求。如果工程质量不合格，承包方应当承担相应的修复费用或损失赔偿责任。
法律责任与处罚：
- 发包方明知承包方无资质或挂靠资质仍与其签订合同，不仅合同无效，还可能面临法律责任和处罚。这包括但不限于罚款、赔偿损失等民事责任，以及可能引发的行政责任甚至刑事责任。
- 此种行为损害了市场秩序和公共利益，相关部门可能会对此进行行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。在严重情况下，还可能构成犯罪，如串通投标罪、合同诈骗罪等，需要承担刑事责任。
建议与防范措施
谨慎审查承包方资质：
- 发包方在签订合同时，应当谨慎审查承包方的资质和信誉，确保承包方具备履行合同所需的能力和条件。这可以通过查询承包方的资质证书、业绩记录、信用评级等方式进行。
选择合规承包方：
- 如果承包方不具备相应资质或存在挂靠资质的情况，发包方应当选择其他具备资质的承包方进行合作。这可以避免潜在的法律风险和纠纷，确保工程的顺利进行和质量的保障。
加强合同管理和风险控制：
- 发包方在合同签订前，应当对合同条款进行仔细审查，确保合同内容合法、合规、明确、具体。同时，在合同履行过程中，应当加强监督和管理，确保承包方按照合同约定履行义务，及时处理可能出现的问题和纠纷。
综上所述，发包方在明确知道承包方是挂靠资质的情况下仍与其签订合同，该合同通常是无效的。为避免法律风险和经济损失，发包方应严格遵守相关法律法规，谨慎选择承包方，并加强合同管理和风险控制。如果您在建设工程或破产重组领域遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。