关于单位实习期加班工资的计算问题，这确实是一个涉及多个法律知识点和实际操作细节的问题。下面我将结合相关法律法规和实际情况，为您详细解答。
一、实习协议与劳动关系认定
首先，我们需要明确实习生与实习单位之间的关系。这通常取决于实习协议的内容以及实习生的具体情况。
实习协议有约定：
- 如果实习协议中明确规定了加班及加班报酬，那么应按照协议执行。这是双方自愿达成的约定，具有法律效力。
实习协议无约定：
- 劳务关系：在校实习生通常不具备劳动者主体资格，与实习单位构成劳务关系。在这种情况下，如果没有加班报酬的约定，实习生要求支付加班工资可能缺乏直接的法律依据。但实习单位出于人文关怀或行业惯例，可能会考虑给予适当补贴或补偿。
- 劳动关系：如果实习生符合特定条件（如已毕业未就业、以就业为目的实习等），可能被认定为与实习单位建立了劳动关系。在这种情况下，实习生的加班就适用劳动法律法规，加班工资的计算也需严格按照法律规定执行。
二、加班时间认定与加班费计算（在劳动关系下）
如果实习生被认定为与实习单位建立了劳动关系，那么加班工资的计算就需遵循《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定。
工作日加班费：
- 加班时间超出每日8小时或每周44小时的部分，视为加班。
- 计算方式：月工资÷21.75÷8×加班小时数×150%。这里，21.75是月平均工作天数，8是每日工作小时数，150%是工作日加班的加班系数。
休息日加班费：
- 休息日安排工作且不能补休的，应支付加班费。
- 计算方式：月工资÷21.75÷8×加班小时数×200%。如果后续安排了补休，则可不支付加班费。
法定节假日加班费：
- 法定节假日安排工作的，应支付加班费。
- 计算方式：月工资÷21.75÷8×加班小时数×300%。法定节假日的加班系数是最高的，体现了对劳动者休息权的尊重。
三、其他注意事项
工资基数：
- 加班工资基数应以劳动合同或集体合同约定的工资标准为准。如果未约定，则按劳动者正常劳动应得工资确定。这是计算加班工资的基础。
最低工资标准：
- 实习生的工资（包括加班工资）不得低于当地最低工资标准。这是法律的强制性规定，旨在保障实习生的基本生活权益。
加班限制：
- 每日加班不得超过1小时，特殊情况下不得超过3小时，每月累计不得超过36小时。超出此限制即为违法，实习生有权拒绝并维护自己的合法权益。
协商与约定：
- 虽然法律有明确规定，但具体支付情况仍可能受实习生与实习单位之间协商和约定的影响。因此，建议双方在合同中明确加班工资事宜，以避免后续纠纷。
四、维权途径
如果实习生认为加班工资未得到合理支付，应先与实习单位协商。协商不成时，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。
综上所述，实习生的加班工资问题涉及多个法律知识点和实际操作细节。在实际操作中，应综合考虑实习协议的约定、劳动关系的认定、加班时间的认定与加班费的计算、工资基数的确定、最低工资标准的遵守、加班时间的限制以及维权途径等因素，确保实习生的合法权益得到充分保障。