关于实习期周末加班工资的计算问题，这确实是一个涉及法律、协议约定以及具体加班情况的综合判断。以下是我为您详细梳理的解答：
一、法律基础与劳动关系认定
首先，我们需要明确实习生与用人单位之间的关系。在校实习生通常不被视为正式的劳动者，因此与实习单位之间可能构成的是劳务关系而非劳动关系。然而，如果实习生符合特定条件（如已毕业未就业、以就业为目的实习等），则可能被认定为与实习单位建立了劳动关系。
劳务关系：
- 在劳务关系下，加班工资的支付主要依据双方之间的实习协议约定。如果协议中明确规定了加班及加班报酬，那么应按照协议执行。
- 若协议中无明确规定，实习生要求支付加班工资可能缺乏直接的法律依据，但实习单位出于公平和合理原则，可考虑给予适当补贴或补偿。
劳动关系：
- 在劳动关系下，实习生的加班工资计算则须严格按照《劳动法》和《劳动合同法》的规定执行。
二、加班工资的具体计算方式
在劳动关系被认定的情况下，我们可以根据《劳动法》的相关规定来计算加班工资：
周末（休息日）加班费：
- 如果周末被安排工作且不能安排补休，那么应支付加班费。
- 计算方式：月工资÷21.75（月计薪天数）÷8（每日工作小时数）×加班小时数×200%（加班系数）。
- 例如，如果实习生的月工资为3000元，周末加班了4小时，那么加班费为：3000÷21.75÷8×4×200%≈137.93元。
若后续安排补休：
- 如果周末加班后，实习单位安排了补休，那么则可不支付加班费。
三、特殊注意事项
工资基数：
- 加班工资的基数应以劳动合同或实习协议中约定的工资标准为准。如果未约定，则按实习生正常劳动应得的工资确定。
最低工资标准：
- 无论采用何种计算方式，实习生的加班工资都不得低于当地最低工资标准。这是保障实习生基本生活权益的重要底线。
加班时间限制：
- 实习单位应合理安排实习生的工作时间和休息时间，避免过度加班。每日加班不得超过1小时，特殊情况下不得超过3小时，每月累计不得超过36小时。超出此限制即为违法。
证据保留：
- 实习生在加班时应保留好相关证据，如加班记录、工作任务单等，以便在必要时维护自己的合法权益。
四、维权途径
如果实习生认为自己的加班工资未得到合理支付，可以先与实习单位进行协商。如果协商不成，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，实习期周末加班工资的计算需结合法律规定、实习协议约定及具体加班情况综合判断。希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。