结论：在合同完工后有欠款，但项目发生问题的情况下，一般不能直接拒付工程款，但具体能否拒付以及拒付的合法性需根据项目问题的性质、合同条款以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、合同条款的约定

1. 合同中是否有明确约定：首先，需要审查建设工程合同中是否明确约定了项目出现问题时，发包方有权拒付工程款的具体情形。如果合同中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么发包方在符合约定条件的情况下，有权拒付工程款。

2. 合同条款的合理性：即使合同中有相关约定，也需要评估该条款的合理性。如果条款过于苛刻或显失公平，可能被认定为无效条款，从而无法作为拒付工程款的依据。

二、项目问题的性质

1. 质量问题：如果项目出现质量问题，且该问题是由于承包方的原因造成的，发包方有权要求承包方进行修复或赔偿损失。在修复或赔偿完成前，发包方可以依据合同约定或法律规定，暂缓支付部分或全部工程款。但需要注意的是，发包方不能直接拒付工程款，而应通过合法途径解决争议。

2. 非质量问题：如果项目出现的问题并非质量问题，而是由于其他原因（如设计变更、政策调整等）导致的，发包方一般不能直接拒付工程款。此时，双方应协商解决争议，或依据合同约定和法律规定，通过调解、仲裁或诉讼等方式解决。

三、法律法规的规定

1. 《民法典》的相关规定：根据《民法典》的相关规定，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。如果发包方无正当理由拒付工程款，承包方有权要求发包方支付工程款及逾期利息。同时，如果发包方拒付工程款的行为构成违约，承包方还有权要求发包方承担违约责任。

2. 建设工程领域的特别规定：在建设工程领域，还有一些特别的规定和司法解释，如《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》等。这些规定和解释对工程款的支付、争议解决等方面都有详细的规定，需要在实际操作中予以遵循。

四、实际操作建议

1. 协商解决：在项目出现问题时，双方应首先尝试通过协商解决争议。通过友好沟通，双方可以达成共识，避免不必要的法律纠纷。

2. 寻求专业帮助：如果协商无果，双方可以寻求专业律师或调解机构的帮助。律师或调解机构可以提供专业的法律意见和调解服务，帮助双方解决争议。

3. 依法维权：如果争议无法通过协商和调解解决，双方可以依法通过仲裁或诉讼等方式维护自己的合法权益。在仲裁或诉讼过程中，双方需要提供充分的证据来支持自己的主张。

总结：在合同完工后有欠款，但项目发生问题的情况下，发包方不能直接拒付工程款。而是需要根据合同条款、项目问题的性质以及相关法律法规综合判断，通过合法途径解决争议。如果您在建设工程合同纠纷或债务债权方面遇到法律问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律意见和帮助。