加班时间长，劳动者完全有权申请劳动仲裁来维护自身合法权益。以下是从多个角度对这一问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；特殊原因下需延长工作时间，在保障劳动者身体健康的条件下，每日不得超过三小时，且每月累计不得超过三十六小时。若公司违反此规定，即构成对劳动者合法权益的侵害，劳动者有权通过劳动仲裁途径寻求救济。

二、仲裁准备材料与事项

材料准备

1. 证明劳动关系的材料：包括但不限于劳动合同、工资条、工作证、考勤记录等，这些材料用于证明劳动者与公司的劳动关系及入职时间、岗位等信息。
2. 加班证据：这是仲裁中的关键部分，应包括加班审批表、加班打卡记录、与加班相关的工作邮件、聊天记录等，以详细证明加班的时间、天数及具体情况。
3. 仲裁申请书：应明确写明加班的详细情况、未支付加班费的具体状况以及具体的仲裁请求，如要求支付加班费、改正违法加班制度等。
4. 身份证复印件：用于确认劳动者的身份。
5. 用人单位的工商登记信息或营业执照复印件：用于确定被申请人的身份。

注意事项

1. 明确仲裁请求：劳动者在提起仲裁时，应清晰明确地提出自己的仲裁请求，包括要求支付的加班费（平时加班150%、休息日加班200%、法定休假日加班300%）以及改正违法加班制度等。
2. 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自劳动者知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者应及时提起仲裁申请，避免超过时效。
3. 配合仲裁委：在仲裁过程中，劳动者应积极配合仲裁委的工作，及时提交充足可靠的资料和证据，并保持与仲裁委的良好沟通，以提高仲裁效率。
4. 执行裁决：若仲裁委裁决用人单位应支付加班工资等费用，用人单位应在规定时间内履行裁决。如用人单位不履行，劳动者可向法院申请强制执行。

三、实际操作建议

1. 尝试沟通：在正式提起劳动仲裁前，建议劳动者首先尝试与用人单位进行沟通，明确表达自己对过度加班的不满和诉求。这一步骤不仅有助于双方理解彼此立场，还可能促使公司主动调整工作安排，避免不必要的法律纠纷。
2. 收集证据：若沟通无果，劳动者应开始积极收集证据，为后续劳动仲裁做准备。关键证据包括加班事实证据（如考勤记录、加班通知、工作成果等）和劳动合同、工资条等。
3. 确定仲裁请求：基于收集到的证据，劳动者应明确自己的仲裁请求，主要包括支付加班工资和其他相关请求（如因长期加班导致身体不适产生的医疗费用等）。
4. 申请劳动仲裁：按照上述材料准备和注意事项，向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请书及证据材料。

四、法律后果

若劳动者成功申请劳动仲裁并获得裁决支持，用人单位将需要支付加班工资等费用，并可能面临改正违法加班制度的法律责任。若用人单位不履行裁决，劳动者可向法院申请强制执行，确保自身合法权益得到有效维护。

综上所述，加班时间长时，劳动者不仅有权申请劳动仲裁，还应充分了解相关法律法规和仲裁程序，准备好充分的证据材料，并积极配合仲裁委的工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。