单位长时间放假超过国家法定节假日时，考勤表的标记应遵循以下原则和方法：

1. 明确放假性质与依据

   • 首先需明确此次长时间放假的性质，是单位自主决定的福利性假期、因特殊原因（如疫情、自然灾害等）的临时停工，还是其他法定情形外的放假。不同性质的放假，考勤标记方式可能有所不同。
   • 若是单位自主福利性假期，且未违反法律法规及劳动合同约定，考勤表可标记为“单位福利假”或类似名称，并注明具体放假天数。
   • 若是因特殊原因临时停工，考勤表可标记为“停工待岗”或“特殊原因放假”，并附上相关证明文件或通知作为依据。

2. 考勤标记的具体操作

   • 日期标记：在考勤表中清晰标注出放假的起始日期和结束日期，确保与实际放假时间一致。
   • 状态标记：根据放假性质，在考勤表中对应日期下标记为“假”、“停工”或其他适当的状态名称。
   • 备注说明：在考勤表下方或相应位置添加备注，简要说明放假的原因、性质及依据，以便后续查阅和审核。

3. 合规性与合法性审查

   • 在进行考勤标记前，应确保此次放假行为本身符合法律法规及劳动合同的约定。例如，单位不得随意延长法定节假日外的假期而损害员工权益。
   • 若放假涉及员工工资支付、社会保险缴纳等权益问题，应提前与员工沟通并达成一致，确保考勤标记与实际权益处理相符。

4. 后续管理与记录保存

   • 考勤表作为单位管理的重要文件，应妥善保存并定期归档。对于长时间放假的考勤记录，更应确保其完整性和可追溯性。
   • 若后续因放假问题引发劳动争议或法律纠纷，考勤表将作为重要证据之一。因此，在标记和保存过程中应保持谨慎和严谨。

总结来说，单位长时间放假超过国家法定节假日时，考勤表的标记应明确放假性质与依据、具体操作合规、进行合规性与合法性审查，并做好后续管理与记录保存工作。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请随时向我咨询。