结论：针对您提出的问题，兄妹间原本签订了房子给妹妹的协议，但哥哥去世后其孩子不签署过户协议，这确实是一个涉及继承权和协议履行的问题。以下是从不同角度给出的详细分析和建议。
一、协议的法律效力
首先，需要明确的是，兄妹之间签订的关于房产归属的协议，在双方自愿、平等、公平的基础上，且不违反法律法规的强制性规定时，是具有法律效力的。这份协议在哥哥生前是有效的，对双方都有约束力。然而，当哥哥去世后，其遗产（包括房产）的继承问题就涉及到了继承法的相关规定。
二、继承权的行使
法定继承：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果哥哥没有留下遗嘱，那么其遗产将按照法定继承顺序进行分配。第一顺序继承人包括配偶、子女、父母。因此，哥哥的孩子作为法定继承人之一，有权继承哥哥的遗产，包括房产的一部分或全部（具体取决于其他继承人的情况）。
遗嘱继承：如果哥哥生前留下了遗嘱，并且遗嘱中明确指定了房产的归属，那么应当按照遗嘱来执行。但在此案例中，并未提及遗嘱的存在，所以我们主要考虑法定继承的情况。
三、协议与继承权的冲突与解决
协议履行与继承权的协调：尽管兄妹之间签订了协议，但哥哥去世后，其孩子作为法定继承人，有权对遗产提出主张。如果孩子不同意过户，这实际上构成了对原协议履行的一种阻碍。在这种情况下，妹妹不能直接依据原协议要求孩子过户，因为孩子的继承权是受到法律保护的。
协商与调解：建议妹妹首先尝试与哥哥的孩子进行协商，看是否能够达成一个双方都能接受的解决方案。比如，可以协商给予孩子一定的经济补偿，以换取其同意过户。如果协商不成，可以考虑寻求第三方调解机构的帮助，如人民调解委员会等。
法律途径：如果协商和调解都无法解决问题，妹妹可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这可能包括向法院提起诉讼，要求确认原协议的效力，并请求法院判决哥哥的孩子履行过户义务。但需要注意的是，诉讼过程可能较为复杂且耗时较长，且结果具有不确定性。
四、特殊情况考虑
如果哥哥的孩子未成年：在这种情况下，可能需要考虑孩子的监护人（通常是父母）的意见和态度。如果监护人同意过户，那么问题可能相对容易解决；如果监护人不同意，则需要通过法律途径来寻求解决方案。
如果房产存在其他共有人：如果房产并非哥哥一人所有，而是存在其他共有人（如配偶、父母等），那么过户问题将更加复杂。在这种情况下，需要考虑到所有共有人的权益和意见。
五、建议与总结
建议妹妹首先尝试与哥哥的孩子进行友好协商，看是否能够达成一个双方都能接受的解决方案。
如果协商不成，可以考虑寻求第三方调解机构的帮助，以更高效地解决问题。
如果必要且条件允许，妹妹可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，但需要做好充分的准备和应对可能的风险。
最后，我想强调的是，每个案件都有其独特性和复杂性，因此在实际操作中需要根据具体情况来制定合适的解决方案。如果您有任何进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。