结论：同一个厂里有的员工加班有的不加班，且加班与否由工厂单方面决定的情况，不一定合法，具体取决于工厂是否遵守了相关劳动法律法规中关于加班的规定。
分析说明：
加班的自愿性原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，加班应当是员工自愿的，工厂不能强制员工加班。如果工厂单方面决定哪些员工加班、哪些不加班，且未征得员工同意，这种做法可能违反了加班的自愿性原则。
加班的补偿与限制：
- 即使员工同意加班，工厂也需要按照法律规定支付加班费，并且加班时间也受到严格限制。例如，每日加班时间一般不得超过一小时，特殊情况下不得超过三小时，且每月加班时间累计不得超过三十六小时。如果工厂未遵守这些规定，即使员工同意加班，也可能构成违法行为。
工厂的规章制度与劳动合同：
- 工厂的规章制度以及与员工签订的劳动合同中，应当明确加班的相关规定。如果规章制度或劳动合同中未明确规定加班事宜，或者规定与法律法规相冲突，那么工厂单方面决定加班的做法可能缺乏合法依据。
特殊情况下的加班：
- 在某些特殊情况下，如生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的，以及法律、行政法规规定的其他情形，工厂可以安排员工加班，但同样需要遵守相关法律法规的规定，如支付加班费、限制加班时间等。
法律建议：
- 对于员工：如果认为工厂的加班安排不合法或不合理，可以与工厂进行沟通协商，要求工厂遵守相关法律法规。如果沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于工厂：应当严格遵守相关劳动法律法规中关于加班的规定，确保加班的自愿性、支付加班费以及限制加班时间等。同时，建议在规章制度和劳动合同中明确加班的相关规定，以避免不必要的法律纠纷。
可能后果：
- 如果工厂违反相关法律法规关于加班的规定，可能会面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，员工也有权要求工厂支付加班费、经济补偿等，甚至可能因此解除劳动合同并要求工厂支付赔偿金。
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