结论：早退扣工资是否合法，不能一概而论，需根据具体情况和公司规章制度来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 公司规章制度的角度

   • 合法情况：如果公司规章制度中明确规定了早退的扣罚标准，并且该规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定），且已向劳动者公示或告知，那么公司依据规章制度对早退员工进行扣工资是合法的。这是因为公司有权根据自身经营管理的需要，制定合理的规章制度来规范员工的行为。
   • 不合法情况：如果公司规章制度中没有明确规定早退的扣罚标准，或者规章制度未经民主程序制定，或者未向劳动者公示或告知，那么公司擅自对早退员工进行扣工资则可能构成违法。因为这种情况下，公司的规章制度对员工不具有约束力，公司不能依据无效的规章制度来处罚员工。

2. 扣罚金额的角度

   • 合法情况：即使公司规章制度中规定了早退的扣罚标准，但扣罚的金额也应当合理。一般来说，扣罚的金额不应超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地的最低工资标准。如果公司扣罚的金额在这个范围内，那么是合法的。
   • 不合法情况：如果公司扣罚的金额超过了员工当月工资的20%，或者扣除后的剩余工资低于当地的最低工资标准，那么这种扣罚就是违法的。因为根据相关法律法规，公司不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，且扣罚的金额应当合理。

3. 实际操作的角度

   • 存在差异的原因：在实际操作中，为什么有的人早退被扣工资，有的人却没有被扣呢？这可能是因为不同员工的早退情况不同（如早退的时间、频率等），或者公司对不同员工的处理方式存在差异。但无论如何，公司的处理方式都应当符合上述的合法性标准。
   • 建议：如果员工认为公司对其早退的扣罚不合法或不合理，可以先与公司进行沟通协商，要求公司出示相关的规章制度和扣罚依据。如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

总结与建议：早退扣工资是否合法，需根据公司的规章制度、扣罚金额以及实际操作情况来判断。作为员工，应当了解并遵守公司的规章制度；作为公司，也应当制定合理、合法的规章制度，并确保其得到严格执行。如果遇到相关问题，建议及时咨询专业律师或相关机构，以获取更准确的法律意见和帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。