教师迟到早退扣工资在一定条件下是合法的，但必须符合规章制度明确、程序合法、扣罚合理等条件。以下是对这一问题的详细分析：
合法的条件
规章制度明确且合理：
- 学校作为用人单位，应依法制定内部规章制度，明确规定教师迟到早退的扣薪标准。这一标准需要具体、明确，不能含糊不清。
- 规章制度需经过民主程序制定，如教职工代表大会或全体教师讨论通过，并已向教师公示告知。这是确保规章制度合法性的重要步骤。
- 扣薪标准应公平合理，不能明显侵害教师权益。例如，扣薪额度应与迟到早退的时间长度、对工作的影响程度等因素相匹配。
劳动合同有约定：
- 若劳动合同中明确约定了教师迟到早退属于违反合同约定的行为，并规定了相应的扣薪条款，该条款也需公平合理。
- 劳动合同中的扣薪约定应与规章制度相一致，且不能违反法律法规的强制性规定。例如，不能约定过高的扣薪比例或违反最低工资标准的规定。
扣罚合理：
- 扣工资的额度应当合理，确保扣罚金额与教师的过错相适应。一般来说，扣罚金额不应超出教师当月应得薪酬的一定比例（如20%），且扣除后的剩余工资不能低于当地最低工资标准。
- 扣罚应基于实际迟到早退的情况，不能随意扩大扣罚范围或提高扣罚标准。
不合法的情形
无规章制度或程序不合法：
- 如果学校没有相关规章制度，或规章制度的制定程序不合法（如未经过民主程序、未公示告知），则直接扣工资的行为不合法。
扣罚标准过高或不合理：
- 如果扣罚标准过高，导致教师工资大幅减少，甚至影响其基本生活，这种扣工资行为也可能被认定为不合法。
- 扣罚标准应与实际情况相符，不能明显偏高或偏低。例如，不能因为教师迟到几分钟就扣除其整天的工资。
员工（教师）权益保护
面对不合法的扣工资行为，教师可以采取以下措施维护自己的合法权益：
与学校协商解决：首先尝试与学校沟通，表达异议和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。例如，可以提出调整扣薪标准或改进考勤管理方式的建议。
向劳动监察部门投诉：若协商无果，教师可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。劳动监察部门有权对学校的违法行为进行查处，并要求学校改正。
申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，教师可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。劳动仲裁或诉讼是解决劳动争议的有效途径，可以确保教师的合法权益得到保障。
综上所述，教师迟到早退扣工资是否合法取决于多个因素的综合考量。学校应确保规章制度的合法性、合理性和透明性；教师也应了解自己的权益和维权途径，并在必要时依法维护自己的合法权益。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。