结论：原告起诉案由是劳务款但举证全是工程证明据，法院是否立案需视具体情况而定，不能一概而论。不过，仅从案由与证据不完全匹配这一点来看，并不直接导致法院不予立案，但可能会影响案件的审理方向和最终判决。
分析说明：
立案标准：
- 法院立案主要审查的是原告的起诉是否符合法律规定的起诉条件，包括原告是否与本案有直接利害关系、是否有明确的被告、是否有具体的诉讼请求和事实、理由，以及是否属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
- 案由与证据不完全匹配，并不直接构成法院不予立案的理由。只要起诉符合上述基本条件，法院通常会予以立案。
证据与案由的关系：
- 案由是原告对诉讼性质的概括，而证据则是用来支持其诉讼请求和事实、理由的材料。
- 如果原告起诉的案由是劳务款，但提供的证据主要是工程证明据，这可能会让法院在审理时对案件性质产生疑问，需要进一步审查证据与诉讼请求之间的关联性。
- 然而，这并不意味着法院会因此不予立案。法院会在立案后，通过审理过程来查明事实，并根据证据和法律规定作出判决。
可能的法律后果：
- 如果原告提供的证据确实无法支持其以劳务款为案由的诉讼请求，法院可能会在审理过程中要求原告补充证据或变更诉讼请求。
- 如果原告无法提供足够证据支持其诉讼请求，或者证据与诉讼请求之间缺乏关联性，法院可能会驳回原告的诉讼请求。
建议：
- 完善证据：原告应尽可能收集与劳务款相关的证据，如劳务合同、工资单、工作记录等，以支持其诉讼请求。
- 明确诉讼请求：原告应明确其诉讼请求，并确保诉讼请求与提供的证据相匹配。如果案由与证据存在不完全匹配的情况，原告应在起诉时或审理过程中进行合理解释和说明。
- 咨询专业律师：在涉及法律纠纷时，咨询专业律师是非常重要的。律师可以根据具体情况提供法律意见和帮助，确保原告的合法权益得到有效维护。
特殊场景：
- 如果原告确实无法提供与劳务款直接相关的证据，但能够提供其他间接证据或情况说明，法院也可能会根据具体情况进行审理和判决。不过，这种情况下原告的诉讼请求得到支持的可能性可能会降低。
行动指南：
- 如果你作为原告面临这样的情况，建议尽快收集和完善相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律意见和帮助。
- 在起诉前或审理过程中，与法院保持沟通，了解案件进展和法院的要求，以便及时调整诉讼策略。
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