公司三天内连续开两份处罚单是否合法，取决于处罚单的具体内容、开具的依据以及是否遵循了相关法律规定和公司规章制度。下面我将从几个角度进行详细分析：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位有权对劳动者进行管理和处罚，但处罚必须基于合法、合理且公正的原则。
- 处罚单的内容应当明确、具体，且不得违反法律法规的强制性规定。
公司规章制度：
- 公司内部通常会有详细的员工手册或规章制度，其中应包含对员工处罚的相关规定。
- 如果公司规章制度中明确规定了处罚的种类、程序及条件，那么公司在开具处罚单时必须严格遵守这些规定。
处罚的合理性：
- 处罚应当与员工的违纪行为相匹配，既不过轻也不过重。
- 公司在连续开具处罚单时，应当考虑员工是否有改正的机会，以及连续处罚是否会对员工造成不公平的影响。
程序正当性：
- 公司在开具处罚单前，应当确保已经进行了充分的调查，并且给予了员工陈述和申辩的机会。
- 处罚单应当正式送达给员工，并且注明处罚的依据、理由及执行方式。
综上所述，公司三天内连续开两份处罚单是否合法，关键在于处罚单是否符合法律法规、公司规章制度以及处罚的合理性、程序正当性。如果处罚单在上述方面都符合规定，那么连续开具两份处罚单可能是合法的。但如果存在任何违法或不当之处，员工有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
因此，建议你仔细审查处罚单的内容及开具程序，如果认为处罚存在不当之处，可以及时向公司提出异议或咨询专业律师以维护自己的合法权益。