员工因违章指挥造成工伤后选择离职，其能获得的经济补偿主要包括工伤赔偿和离职经济补偿两部分。以下是对这两部分补偿的详细分析：

工伤赔偿

1. 医疗费用：员工因工伤产生的医疗费用，包括治疗费、药费、住院费等，应由工伤保险基金或用人单位承担。这是工伤赔偿中最直接且必要的一部分。

2. 停工留薪期工资：在停工留薪期内，员工原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。

3. 伤残补助金：根据工伤鉴定结果，员工可能获得一次性伤残补助金。伤残等级越高，补助金数额越大。具体标准依据《工伤保险条例》的相关规定执行。

4. 伤残津贴：对于伤残等级较高（如一级至四级伤残）的员工，可能还需按月领取伤残津贴。伤残津贴的实际金额低于当地最低工资标准的，由工伤保险基金补足差额。

5. 其他赔偿：根据具体情况，员工还可能获得一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金等。这些赔偿的具体标准和条件也依据《工伤保险条例》及地方相关规定执行。

离职经济补偿

1. 经济补偿金：如果员工因用人单位违章指挥等违法行为而选择离职，且符合《劳动合同法》规定的解除劳动合同情形（如用人单位未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件等），员工有权要求用人单位支付经济补偿金。经济补偿金的标准按照员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。

2. 特殊情况下的赔偿：如果用人单位的违章指挥行为对员工造成了严重损害（如构成工伤且伤残等级较高），员工在离职时除了要求工伤赔偿外，还可以根据《劳动合同法》的相关规定，要求用人单位支付额外的赔偿金。但这种情况下的赔偿金数额和支付条件需根据具体案情和法律规定进行判断。

综合建议：

• 员工在因违章指挥造成工伤后选择离职时，应首先确保自己的工伤得到妥善认定和赔偿。这包括及时申请工伤认定、进行劳动能力鉴定以及与用人单位协商或通过法律途径解决工伤赔偿问题。
• 在离职过程中，员工应了解自己的权益和用人单位的义务，确保自己能够获得应有的经济补偿。如果用人单位拒绝支付或支付不足，员工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
• 鉴于工伤赔偿和离职经济补偿涉及的法律问题较为复杂，建议员工在处理此类问题时咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。

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